More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_05391 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_05391  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
156 aa  312  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.589917  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0475  50S ribosomal protein L19  83.33 
 
 
156 aa  258  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05301  50S ribosomal protein L19  80.77 
 
 
159 aa  254  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05001  50S ribosomal protein L19  81.41 
 
 
159 aa  254  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0643  50S ribosomal protein L19  73.65 
 
 
158 aa  214  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04761  ribosomal protein L19  79.1 
 
 
163 aa  213  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.603852  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06821  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 
158 aa  209  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1716  50S ribosomal protein L19  83.76 
 
 
150 aa  208  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05311  50S ribosomal protein L19  70.39 
 
 
162 aa  207  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.105613 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1808  50S ribosomal protein L19  82.05 
 
 
162 aa  206  7e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0350868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2549  50S ribosomal protein L19  73.5 
 
 
130 aa  187  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000188294  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0439  ribosomal protein L19  75.21 
 
 
120 aa  186  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123556  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2541  50S ribosomal protein L19  73.5 
 
 
137 aa  181  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00272416  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1043  50S ribosomal protein L19  72.65 
 
 
120 aa  181  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00000555964  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1743  50S ribosomal protein L19  69.83 
 
 
120 aa  177  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1767  50S ribosomal protein L19  69.83 
 
 
120 aa  177  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00973634  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0268  50S ribosomal protein L19  67.48 
 
 
127 aa  174  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.118712  normal  0.0551314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1023  ribosomal protein L19  68.38 
 
 
120 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00623227 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 
115 aa  140  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
114 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  57.39 
 
 
120 aa  135  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  53.1 
 
 
124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 
115 aa  134  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  56.52 
 
 
117 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0090  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0076  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 
113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1206  50S ribosomal protein L19  54.7 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000437176  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  52.94 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2409  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 
116 aa  131  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.116113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  57.39 
 
 
128 aa  131  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 
128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0430  ribosomal protein L19  54.95 
 
 
121 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575588  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  57.26 
 
 
131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
115 aa  130  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  56.14 
 
 
115 aa  130  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
115 aa  130  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 
116 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
115 aa  130  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  56.14 
 
 
115 aa  130  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
115 aa  130  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 
116 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
115 aa  130  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 
117 aa  130  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 
116 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
115 aa  130  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
115 aa  130  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 
126 aa  130  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
115 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
115 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
115 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4154  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
116 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
115 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 
132 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
115 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  55.93 
 
 
145 aa  130  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  56.64 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 
183 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0994  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205285  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 
114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 
116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  55.45 
 
 
118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0855  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000174926  hitchhiker  0.0000579637 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0296  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000130489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  56.52 
 
 
126 aa  128  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  53.78 
 
 
140 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2277  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
118 aa  128  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122186  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 
117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
115 aa  128  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
115 aa  128  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3767  50S ribosomal protein L19  50.43 
 
 
120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116222  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 
117 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  55.45 
 
 
116 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1127  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 
115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 
184 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0395  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 
114 aa  127  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0178  ribosomal protein L19  56.76 
 
 
121 aa  127  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0226  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
118 aa  127  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000854826  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0936  50S ribosomal protein L19  54.24 
 
 
128 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0118366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>