More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1871 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1871  ribosomal protein L19  100 
 
 
143 aa  280  4.0000000000000003e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00102894  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
128 aa  130  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  53.17 
 
 
177 aa  130  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 
114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  53.17 
 
 
183 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1023  ribosomal protein L19  53.98 
 
 
120 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00623227 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 
114 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  61.22 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  53.17 
 
 
184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  55.36 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0720  50S ribosomal protein L19  55.08 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 
113 aa  124  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 
113 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 
116 aa  124  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2409  50S ribosomal protein L19  61.22 
 
 
116 aa  123  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.116113 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  56.03 
 
 
119 aa  123  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 
119 aa  122  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  53.51 
 
 
119 aa  122  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  52.54 
 
 
180 aa  122  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  55.36 
 
 
140 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2016  50S ribosomal protein L19  59.41 
 
 
130 aa  122  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113436  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2319  50S ribosomal protein L19  59.41 
 
 
142 aa  122  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.556938  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 
115 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1489  50S ribosomal protein L19  56.48 
 
 
120 aa  121  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448385  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2003  ribosomal protein L19  54.78 
 
 
115 aa  121  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000253757  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1395  50S ribosomal protein L19  54.63 
 
 
120 aa  120  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.021497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 
118 aa  120  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2541  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 
137 aa  120  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00272416  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0268  50S ribosomal protein L19  58.42 
 
 
127 aa  120  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.118712  normal  0.0551314 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  54.63 
 
 
115 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  55.66 
 
 
148 aa  120  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2549  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 
130 aa  120  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000188294  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1767  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 
120 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00973634  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  44.6 
 
 
133 aa  120  8e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1521  50S ribosomal protein L19  54.63 
 
 
120 aa  120  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.309648  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1743  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 
120 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  52.29 
 
 
115 aa  120  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  52.29 
 
 
115 aa  120  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  60.2 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0203  50S ribosomal protein L19  57.58 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000333718  normal  0.100248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  61.22 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  60.2 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  56 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0198  ribosomal protein L19  51.43 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000492639  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  60.2 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 
114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  59.18 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  52.29 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  57.43 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  47.9 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  60.2 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0226  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000854826  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  61.22 
 
 
129 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  60.2 
 
 
126 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0969  50S ribosomal protein L19  52.78 
 
 
120 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25762  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  61.22 
 
 
131 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  61.22 
 
 
131 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  52.14 
 
 
117 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  52.14 
 
 
117 aa  118  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  53.64 
 
 
118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  51.43 
 
 
163 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  61.22 
 
 
131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  51.82 
 
 
119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  59.79 
 
 
132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 
117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  54.29 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 
114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 
114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 
114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 
114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 
114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 
114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 
114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 
114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 
114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  53.21 
 
 
114 aa  117  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 
119 aa  117  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0801  50S ribosomal protein L19  53.7 
 
 
120 aa  117  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 
114 aa  117  7e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1295  50S ribosomal protein L19  54.63 
 
 
121 aa  117  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.816145 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  50.46 
 
 
114 aa  116  7.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  52.14 
 
 
117 aa  116  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0217  50S ribosomal protein L19  53.45 
 
 
131 aa  117  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  52.83 
 
 
115 aa  116  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  59.18 
 
 
126 aa  116  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0439  ribosomal protein L19  54.55 
 
 
120 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123556  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  59.18 
 
 
131 aa  116  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0936  50S ribosomal protein L19  56.86 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0118366 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  51.89 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0879  50S ribosomal protein L19  49.57 
 
 
115 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387585  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3361  50S ribosomal protein L19  49.57 
 
 
115 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.407849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  59.38 
 
 
118 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  57.73 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3225  50S ribosomal protein L19  49.57 
 
 
115 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.639554  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1011  50S ribosomal protein L19  54.72 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0296  50S ribosomal protein L19  50.43 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000130489  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  59.38 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3087  50S ribosomal protein L19  49.57 
 
 
115 aa  116  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228152  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1018  50S ribosomal protein L19  49.58 
 
 
122 aa  115  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00624649  normal  0.659291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>