More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0801 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0801  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
120 aa  237  4e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1521  50S ribosomal protein L19  86.09 
 
 
120 aa  199  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.309648  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1489  50S ribosomal protein L19  83.48 
 
 
120 aa  196  7.999999999999999e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448385  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1395  50S ribosomal protein L19  80.83 
 
 
120 aa  195  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.021497  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0969  50S ribosomal protein L19  80.83 
 
 
120 aa  191  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25762  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1295  50S ribosomal protein L19  77.39 
 
 
121 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.816145 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1018  50S ribosomal protein L19  69.17 
 
 
122 aa  170  6.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00624649  normal  0.659291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  55.26 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 
128 aa  123  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  51.28 
 
 
115 aa  121  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  51.35 
 
 
128 aa  120  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  52.25 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0720  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 
121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 
115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  53.1 
 
 
116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  52.21 
 
 
118 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1871  ribosomal protein L19  53.7 
 
 
143 aa  117  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00102894  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  52.99 
 
 
115 aa  116  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  57.45 
 
 
114 aa  115  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
115 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
115 aa  115  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
115 aa  115  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
115 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1234  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000814658  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1221  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 
115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000033527  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  50.43 
 
 
116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0040  ribosomal protein L19  52.34 
 
 
115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.266371  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  53.33 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  51.33 
 
 
119 aa  114  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  53.27 
 
 
116 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  53.27 
 
 
116 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 
114 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
162 aa  113  7.999999999999999e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 
114 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 
114 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 
114 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 
114 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 
114 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 
114 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 
114 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0195  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 
115 aa  113  8.999999999999998e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 
114 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 
114 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1454  ribosomal protein L19  52.5 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1354  normal  0.387508 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  60.23 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  46.9 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  53.7 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  49.56 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 
115 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  50.88 
 
 
115 aa  111  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  48.7 
 
 
118 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 
115 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 
115 aa  111  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  50.88 
 
 
115 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  52.1 
 
 
118 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 
115 aa  111  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 
115 aa  111  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  48.7 
 
 
118 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 
115 aa  111  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  53.04 
 
 
113 aa  111  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  53.91 
 
 
119 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 
115 aa  111  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  52.1 
 
 
118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  52.17 
 
 
124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  53.7 
 
 
117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 
115 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 
115 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 
115 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 
115 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 
115 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3225  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 
115 aa  110  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.639554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3361  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 
115 aa  110  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.407849  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0879  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 
115 aa  110  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387585  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0395  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 
114 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  52.34 
 
 
116 aa  110  8.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1127  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
115 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
115 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  56.38 
 
 
113 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0296  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
116 aa  110  9e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000130489  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0994  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  51.33 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0855  50S ribosomal protein L19  49.15 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000174926  hitchhiker  0.0000579637 
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  48.33 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0463  50S ribosomal protein L19  50.44 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0439  50S ribosomal protein L19  50.44 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  51.33 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39530  50S ribosomal protein L19  51.33 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0334012  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  48.33 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  53.15 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0887  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00504476  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3087  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228152  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  59.3 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>