More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0195 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0195  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
115 aa  235  2e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1127  50S ribosomal protein L19  81.74 
 
 
115 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3225  50S ribosomal protein L19  82.46 
 
 
115 aa  194  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.639554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3361  50S ribosomal protein L19  82.46 
 
 
115 aa  194  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.407849  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0879  50S ribosomal protein L19  82.46 
 
 
115 aa  194  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387585  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0855  50S ribosomal protein L19  81.74 
 
 
118 aa  194  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000174926  hitchhiker  0.0000579637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  79.13 
 
 
115 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  79.13 
 
 
115 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  79.13 
 
 
115 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  79.13 
 
 
115 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  80 
 
 
115 aa  192  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  79.13 
 
 
115 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  79.13 
 
 
115 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  79.13 
 
 
115 aa  192  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0994  50S ribosomal protein L19  79.13 
 
 
115 aa  191  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205285  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  79.13 
 
 
115 aa  192  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  79.13 
 
 
115 aa  192  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  79.13 
 
 
115 aa  191  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  79.13 
 
 
115 aa  192  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  79.13 
 
 
115 aa  192  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  79.13 
 
 
115 aa  192  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  79.13 
 
 
115 aa  192  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  79.13 
 
 
115 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3087  50S ribosomal protein L19  80.7 
 
 
115 aa  191  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228152  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0296  50S ribosomal protein L19  75.86 
 
 
116 aa  183  6e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000130489  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  69.57 
 
 
117 aa  167  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  69.57 
 
 
117 aa  167  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  68.7 
 
 
117 aa  165  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  68.7 
 
 
117 aa  162  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  66.38 
 
 
117 aa  158  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  66.38 
 
 
117 aa  157  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  66.38 
 
 
117 aa  157  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  66.38 
 
 
117 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  66.38 
 
 
117 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  66.38 
 
 
117 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  66.38 
 
 
117 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  66.38 
 
 
117 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  66.38 
 
 
117 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  66.38 
 
 
117 aa  157  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  69.64 
 
 
115 aa  156  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  66.37 
 
 
120 aa  156  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4066  50S ribosomal protein L19  64.35 
 
 
117 aa  155  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3364  50S ribosomal protein L19  68.7 
 
 
119 aa  155  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.734932  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  65.52 
 
 
117 aa  155  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  65.52 
 
 
117 aa  154  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0887  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 
117 aa  154  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00504476  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1377  50S ribosomal protein L19  68.47 
 
 
116 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.134338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16000  50S ribosomal protein L19  68.47 
 
 
116 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000973438  normal  0.502722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39530  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 
116 aa  152  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0334012  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 
120 aa  152  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0463  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 
121 aa  151  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0439  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 
121 aa  151  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1107  50S ribosomal protein L19  62.39 
 
 
117 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2700  50S ribosomal protein L19  62.71 
 
 
127 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3352  50S ribosomal protein L19  62.71 
 
 
127 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459545  normal  0.21243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  62.71 
 
 
128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3767  50S ribosomal protein L19  65.18 
 
 
120 aa  150  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116222  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1464  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 
130 aa  150  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0684  50S ribosomal protein L19  62.39 
 
 
117 aa  150  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1693  50S ribosomal protein L19  61.02 
 
 
121 aa  150  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  65.18 
 
 
116 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  64.29 
 
 
119 aa  150  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2319  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 
142 aa  150  8e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.556938  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0936  50S ribosomal protein L19  61.34 
 
 
128 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0118366 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2016  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 
130 aa  149  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113436  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5342  ribosomal protein L19  62.71 
 
 
146 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0807  50S ribosomal protein L19  60.5 
 
 
128 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410607  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0878  50S ribosomal protein L19  60.5 
 
 
128 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.714575  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  66.07 
 
 
116 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0395  50S ribosomal protein L19  64.91 
 
 
114 aa  148  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  66.07 
 
 
116 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  66.07 
 
 
116 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  65.79 
 
 
117 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4154  50S ribosomal protein L19  65.18 
 
 
116 aa  147  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1162  50S ribosomal protein L19  67.24 
 
 
117 aa  147  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000263892  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0948  50S ribosomal protein L19  60 
 
 
130 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.757688  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1052  50S ribosomal protein L19  67.24 
 
 
117 aa  147  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000268898  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1066  50S ribosomal protein L19  67.83 
 
 
116 aa  147  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000285851  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0593  50S ribosomal protein L19  60 
 
 
130 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095314  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1072  50S ribosomal protein L19  60 
 
 
130 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1031  50S ribosomal protein L19  60 
 
 
130 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0952  50S ribosomal protein L19  60 
 
 
130 aa  147  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381908  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1257  50S ribosomal protein L19  67.24 
 
 
117 aa  147  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000965232  hitchhiker  0.0000525185 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  60.34 
 
 
126 aa  146  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0203  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 
138 aa  146  8e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000333718  normal  0.100248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1476  ribosomal protein L19  60.34 
 
 
127 aa  146  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  58.47 
 
 
126 aa  146  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2916  50S ribosomal protein L19  59.17 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104076  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2003  ribosomal protein L19  63.48 
 
 
115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000253757  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0400  50S ribosomal protein L19  59.17 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311266  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2965  50S ribosomal protein L19  59.17 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4186  50S ribosomal protein L19  59.17 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.105391  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2856  50S ribosomal protein L19  59.17 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878575  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2231  50S ribosomal protein L19  59.17 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133079  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0772  50S ribosomal protein L19  59.17 
 
 
127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1664  50S ribosomal protein L19  59.17 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1009  50S ribosomal protein L19  59.17 
 
 
128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359648  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0231  50S ribosomal protein L19  59.17 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0916  50S ribosomal protein L19  59.17 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2542  50S ribosomal protein L19  59.17 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0263241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>