More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1221 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1234  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 115 aa  220  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000814658  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1221  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 115 aa  220  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000033527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1800  50S ribosomal protein L19  72.81 
 
 		 115 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0132543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  69.03 
 
 		 116 aa  153  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  65.52 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0325  ribosomal protein L19  62.18 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  68.14 
 
 		 114 aa  148  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  65.22 
 
 		 114 aa  147  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  67.26 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  67.26 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  67.26 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  67.26 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  67.26 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  67.26 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  67.26 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0651  50S ribosomal protein L19  69.3 
 
 		 115 aa  147  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  67.26 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  67.26 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  68.14 
 
 		 113 aa  147  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  66.09 
 
 		 114 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  64.35 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  64.81 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 120 aa  144  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  64.35 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  62.07 
 
 		 116 aa  142  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  60.34 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  64.1 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 121 aa  140  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  64.55 
 
 		 116 aa  140  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  64.55 
 
 		 116 aa  140  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  68.22 
 
 		 114 aa  140  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  61.74 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  57.76 
 
 		 116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  60.87 
 
 		 115 aa  137  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 		 116 aa  137  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  70.09 
 
 		 114 aa  137  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  58.62 
 
 		 117 aa  136  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 118 aa  136  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  63.46 
 
 		 145 aa  136  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  59.65 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  63.46 
 
 		 145 aa  136  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  66.36 
 
 		 113 aa  135  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  61.68 
 
 		 140 aa  135  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0463  50S ribosomal protein L19  63.3 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0439  50S ribosomal protein L19  63.3 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 114 aa  134  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 113 aa  134  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  56.52 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  62.86 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  58.77 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  64.36 
 
 		 130 aa  133  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 118 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  62 
 
 		 163 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 115 aa  133  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  59.63 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 115 aa  133  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  61.17 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  65.14 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  66 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2409  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.116113 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  65.69 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  62.39 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  59.48 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1489  50S ribosomal protein L19  56.03 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448385  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 115 aa  131  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  64.89 
 
 		 177 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  63.83 
 
 		 180 aa  130  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1011  50S ribosomal protein L19  59.62 
 
 		 147 aa  129  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  63.11 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1018  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00624649  normal  0.659291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2561  50S ribosomal protein L19  64.04 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00000880835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  65.35 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  57.39 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1024  50S ribosomal protein L19  58.47 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.688153  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  64.71 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>