More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2561 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2561  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
116 aa  222  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00000880835  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2781  50S ribosomal protein L19  98.28 
 
 
116 aa  219  9e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655123  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2409  50S ribosomal protein L19  78.45 
 
 
116 aa  186  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.116113 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0226  50S ribosomal protein L19  74.11 
 
 
118 aa  170  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000854826  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  65.52 
 
 
118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 
115 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  62.28 
 
 
116 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  64.04 
 
 
114 aa  147  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  62.5 
 
 
118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  64.91 
 
 
114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  64.91 
 
 
114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  64.91 
 
 
114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  64.91 
 
 
114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  64.91 
 
 
114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  64.91 
 
 
114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  64.91 
 
 
114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  64.91 
 
 
114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  64.91 
 
 
114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  64.91 
 
 
114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  65.18 
 
 
115 aa  144  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  63.64 
 
 
113 aa  142  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 
114 aa  141  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  63.06 
 
 
128 aa  141  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 
116 aa  141  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 
113 aa  140  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 
120 aa  140  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  63.06 
 
 
114 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
116 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1206  50S ribosomal protein L19  64.29 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000437176  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
116 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
116 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 
133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  65.22 
 
 
115 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 
114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  63.25 
 
 
119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  68.93 
 
 
115 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 
119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  66.99 
 
 
114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  59.65 
 
 
116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 
128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 
113 aa  138  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 
115 aa  137  6e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 
115 aa  137  7e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1716  50S ribosomal protein L19  61.74 
 
 
150 aa  136  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2541  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 
137 aa  135  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00272416  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05391  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 
156 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.589917  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
119 aa  136  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 
114 aa  135  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0439  ribosomal protein L19  57.89 
 
 
120 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123556  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0090  50S ribosomal protein L19  58.77 
 
 
136 aa  135  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  57.52 
 
 
118 aa  135  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2549  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 
130 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000188294  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  61.26 
 
 
119 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0076  50S ribosomal protein L19  58.77 
 
 
136 aa  135  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1377  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 
116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.134338  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05001  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 
159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16000  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 
116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000973438  normal  0.502722 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  58.26 
 
 
124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0643  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
158 aa  134  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
121 aa  134  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 
145 aa  134  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 
145 aa  134  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0475  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05301  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 
159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1221  50S ribosomal protein L19  70.41 
 
 
115 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000033527  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1234  50S ribosomal protein L19  70.41 
 
 
115 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000814658  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  63.96 
 
 
117 aa  133  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1043  50S ribosomal protein L19  58.77 
 
 
120 aa  133  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00000555964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  65.69 
 
 
145 aa  133  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  61.26 
 
 
115 aa  132  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  57.52 
 
 
119 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  56.52 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  56.9 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  57.39 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4154  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04761  ribosomal protein L19  60.53 
 
 
163 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.603852  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39530  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0334012  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  56.52 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  56.52 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  59.46 
 
 
118 aa  132  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1023  ribosomal protein L19  56.14 
 
 
120 aa  131  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00623227 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  57.66 
 
 
114 aa  131  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1808  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 
162 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0350868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  56.9 
 
 
115 aa  131  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  56.9 
 
 
115 aa  131  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1767  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00973634  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1743  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 
115 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05311  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.105613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
117 aa  130  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  53.98 
 
 
121 aa  130  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
127 aa  130  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  55.93 
 
 
130 aa  130  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  55.26 
 
 
117 aa  130  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  60 
 
 
120 aa  130  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  55.75 
 
 
116 aa  130  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 
114 aa  130  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  59.46 
 
 
119 aa  130  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>