More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1295 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1295  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.816145 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1018  50S ribosomal protein L19  80 
 
 		 122 aa  196  7.999999999999999e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00624649  normal  0.659291 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1521  50S ribosomal protein L19  83.62 
 
 		 120 aa  194  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.309648  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1395  50S ribosomal protein L19  80 
 
 		 120 aa  188  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.021497  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1489  50S ribosomal protein L19  78.45 
 
 		 120 aa  186  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0969  50S ribosomal protein L19  77.59 
 
 		 120 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0801  50S ribosomal protein L19  77.39 
 
 		 120 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  58.33 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 116 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 		 127 aa  126  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  56.07 
 
 		 116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  57.41 
 
 		 114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  56.07 
 
 		 116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 115 aa  125  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 115 aa  124  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 162 aa  123  6e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0720  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 121 aa  123  7e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  55.14 
 
 		 116 aa  123  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1800  50S ribosomal protein L19  55.17 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0132543  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  55.66 
 
 		 114 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  53.85 
 
 		 133 aa  123  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  55 
 
 		 125 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  52.63 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  50.43 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  50.45 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  54.63 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  52.29 
 
 		 113 aa  121  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  51.3 
 
 		 116 aa  121  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3361  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.407849  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0879  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 116 aa  120  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3225  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.639554  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0430  ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0195  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 		 115 aa  120  6e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  53.23 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1454  ribosomal protein L19  55.08 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1354  normal  0.387508 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  53.51 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 119 aa  120  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0296  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 116 aa  120  8e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000130489  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  49.57 
 
 		 119 aa  120  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3087  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  120  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228152  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0855  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000174926  hitchhiker  0.0000579637 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  58.33 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1738  50S ribosomal protein L19  53.85 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0339925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1127  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0994  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205285  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  50.44 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  52.59 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06821  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  53.7 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0325  ribosomal protein L19  52.5 
 
 		 119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  54.63 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  53.7 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  50.91 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0439  ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123556  normal  0.5766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>