More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1395 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1395  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 120 aa  240  5e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.021497  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1521  50S ribosomal protein L19  88.33 
 
 		 120 aa  216  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.309648  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1489  50S ribosomal protein L19  90.52 
 
 		 120 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0969  50S ribosomal protein L19  87.5 
 
 		 120 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0801  50S ribosomal protein L19  80.83 
 
 		 120 aa  195  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1295  50S ribosomal protein L19  80 
 
 		 121 aa  188  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.816145 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1018  50S ribosomal protein L19  75 
 
 		 122 aa  186  9e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00624649  normal  0.659291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  57.39 
 
 		 124 aa  140  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0720  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 114 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 114 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 114 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 114 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 114 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 114 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 114 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 114 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 114 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  54.72 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  54.72 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 124 aa  124  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 115 aa  124  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  48.7 
 
 		 113 aa  123  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0040  ribosomal protein L19  53.7 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.266371  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  53.77 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  48.21 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  50.89 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  52.25 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1454  ribosomal protein L19  55.08 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1354  normal  0.387508 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  54.78 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1716  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06821  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1871  ribosomal protein L19  54.63 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00102894  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1234  50S ribosomal protein L19  54.31 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000814658  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1221  50S ribosomal protein L19  54.31 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000033527  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  49.57 
 
 		 116 aa  120  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1011  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  50 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  47.41 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0643  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  47.41 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  52.5 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 177 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0325  ribosomal protein L19  52.5 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1043  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00000555964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  52.5 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  50.91 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0430  ribosomal protein L19  51.33 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  46.43 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  51.35 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 183 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  55.66 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  52.25 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3767  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116222  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  47.32 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2541  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00272416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1206  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000437176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  53.7 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  51.75 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  51.35 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  51.67 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  47.79 
 
 		 115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  56.73 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 		 115 aa  117  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  52.25 
 
 		 184 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1743  50S ribosomal protein L19  50.89 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1767  50S ribosomal protein L19  50.89 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00973634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3361  50S ribosomal protein L19  50 
 
 		 115 aa  116  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.407849  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0439  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 121 aa  117  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3225  50S ribosomal protein L19  50 
 
 		 115 aa  116  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.639554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>