More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1743 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1767  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
120 aa  236  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00973634  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1743  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
120 aa  236  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1023  ribosomal protein L19  83.33 
 
 
120 aa  202  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00623227 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2541  50S ribosomal protein L19  79.17 
 
 
137 aa  198  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00272416  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1043  50S ribosomal protein L19  80.83 
 
 
120 aa  193  6e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00000555964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2549  50S ribosomal protein L19  79.17 
 
 
130 aa  189  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000188294  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0439  ribosomal protein L19  77.5 
 
 
120 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123556  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0268  50S ribosomal protein L19  74.8 
 
 
127 aa  187  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.118712  normal  0.0551314 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05001  50S ribosomal protein L19  70.34 
 
 
159 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05301  50S ribosomal protein L19  69.49 
 
 
159 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05391  50S ribosomal protein L19  69.83 
 
 
156 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.589917  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1808  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 
162 aa  175  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0350868  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06821  50S ribosomal protein L19  72.88 
 
 
158 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0643  50S ribosomal protein L19  69.49 
 
 
158 aa  175  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0475  50S ribosomal protein L19  72.57 
 
 
156 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05311  50S ribosomal protein L19  72.03 
 
 
162 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.105613 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1716  50S ribosomal protein L19  68.64 
 
 
150 aa  174  5e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04761  ribosomal protein L19  68.38 
 
 
163 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.603852  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 
114 aa  142  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
115 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 
116 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 
120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 
115 aa  134  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 
120 aa  133  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  55.17 
 
 
124 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  56.52 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  55.75 
 
 
115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  55.75 
 
 
115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 
116 aa  130  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0994  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
115 aa  130  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205285  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
115 aa  130  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 
117 aa  130  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  57.66 
 
 
117 aa  130  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0855  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
118 aa  130  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000174926  hitchhiker  0.0000579637 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 
117 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 
117 aa  129  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1127  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3225  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.639554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3361  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.407849  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0879  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387585  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
115 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
115 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 
117 aa  128  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
115 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
115 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
115 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  59.46 
 
 
118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3087  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228152  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1533  ribosomal protein L19  65.45 
 
 
118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121036  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 
117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 
117 aa  127  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  58.77 
 
 
116 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  58.72 
 
 
113 aa  127  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  58.77 
 
 
116 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  57.39 
 
 
128 aa  127  8.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
113 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  58.56 
 
 
116 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0296  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000130489  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1299  ribosomal protein L19  55.86 
 
 
115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0178063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1162  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000263892  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  59.63 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1052  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000268898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2409  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.116113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  59.63 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0226  50S ribosomal protein L19  55.17 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000854826  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  55.75 
 
 
124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  55.75 
 
 
119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 
114 aa  124  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2403  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 
115 aa  124  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>