More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0198 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0198  ribosomal protein L19  100 
 
 		 115 aa  228  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000492639  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  65.77 
 
 		 114 aa  157  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  63.3 
 
 		 113 aa  150  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  65.14 
 
 		 114 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 114 aa  148  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  62.39 
 
 		 128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 116 aa  144  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  63.89 
 
 		 114 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  63.3 
 
 		 114 aa  143  8.000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  57.39 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  63.89 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  63.89 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  63.89 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  63.89 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  63.89 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  63.89 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  63.89 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  63.89 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  59.63 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  63.89 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 114 aa  140  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 115 aa  139  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  53.78 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 		 116 aa  137  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  60.19 
 
 		 116 aa  137  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  58.72 
 
 		 113 aa  137  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  61.11 
 
 		 116 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  60.55 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  58.72 
 
 		 119 aa  135  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  60.91 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  58.72 
 
 		 114 aa  136  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  61.11 
 
 		 116 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 177 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3101  ribosomal protein L19  57.76 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729095 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  56.88 
 
 		 121 aa  134  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  56.88 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  56.88 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  56.78 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  56.78 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  53.45 
 
 		 132 aa  133  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 113 aa  133  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 115 aa  133  9e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 115 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  61.32 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 		 115 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  57.8 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  57.8 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  58.72 
 
 		 118 aa  131  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  62.04 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  62.04 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  62.04 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  55.93 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  62.04 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  62.04 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  60.55 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  55.05 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  56.78 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  62.04 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  56.88 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  62.04 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  62.04 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  62.04 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  59.26 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  55.05 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  59.26 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  56.78 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  58.72 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  58.72 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  62.04 
 
 		 117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 		 115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 		 115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 		 113 aa  130  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  62.04 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  55.17 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  59.26 
 
 		 124 aa  130  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  60.4 
 
 		 117 aa  130  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  61.11 
 
 		 115 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  58.72 
 
 		 113 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 		 113 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 		 113 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 		 113 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  56.88 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  55 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  55.08 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1299  ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0178063  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  53.85 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  56.88 
 
 		 116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  61.11 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>