More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1392 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1392  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 109 aa  216  8.999999999999998e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0427699  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  62.26 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  63.21 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  65.31 
 
 		 114 aa  133  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  60.38 
 
 		 116 aa  133  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  63.27 
 
 		 113 aa  133  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  57.8 
 
 		 113 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  62.24 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  62.24 
 
 		 114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  62.24 
 
 		 114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  62.24 
 
 		 114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  62.24 
 
 		 114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  62.24 
 
 		 114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  62.24 
 
 		 114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  62.24 
 
 		 114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  62.24 
 
 		 114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  62.24 
 
 		 114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  58.76 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  61.22 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  57.58 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  58.1 
 
 		 114 aa  123  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  57.58 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  54.63 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  59.18 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  54.63 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  59.18 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  58.16 
 
 		 113 aa  120  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  57.73 
 
 		 141 aa  121  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  55.88 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  57.28 
 
 		 116 aa  120  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  59.18 
 
 		 116 aa  120  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  59.18 
 
 		 116 aa  120  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  58.16 
 
 		 118 aa  120  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  56.7 
 
 		 140 aa  120  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  54.64 
 
 		 145 aa  120  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1738  50S ribosomal protein L19  59.79 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0339925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0217  50S ribosomal protein L19  58.33 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 177 aa  120  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  51.38 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  58.51 
 
 		 134 aa  120  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  58.51 
 
 		 134 aa  120  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2150  50S ribosomal protein L19  58.59 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  58.51 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  60.2 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  58.51 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  55.21 
 
 		 183 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0341  50S ribosomal protein L19  56.48 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3678  ribosomal protein L19  57 
 
 		 196 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  55.21 
 
 		 180 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  58.16 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  56.12 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  51.85 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  60.2 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  59.18 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  58.51 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  58.33 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  52.53 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  52.53 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  56.12 
 
 		 113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  56.12 
 
 		 113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  56.86 
 
 		 114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  56.12 
 
 		 113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  50.5 
 
 		 118 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  54.17 
 
 		 184 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  49.54 
 
 		 118 aa  117  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  52.73 
 
 		 125 aa  117  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  55.1 
 
 		 113 aa  117  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  54.21 
 
 		 115 aa  117  7e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  56.12 
 
 		 119 aa  117  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  54.21 
 
 		 115 aa  117  7e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  54 
 
 		 129 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  51.85 
 
 		 127 aa  116  7.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  56.38 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  55.1 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  53.7 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  54.08 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  55.1 
 
 		 113 aa  115  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  56.12 
 
 		 116 aa  115  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1221  50S ribosomal protein L19  60.2 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000033527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  56.38 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0742  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  52.78 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  53.61 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1234  50S ribosomal protein L19  60.2 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000814658  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  53.54 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1011  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3279  50S ribosomal protein L19  59.38 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>