More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0324 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0324  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  100 
 
 
905 aa  1878    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.496099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2449  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.22 
 
 
894 aa  646    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0704  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.76 
 
 
896 aa  639    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3716  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  40.15 
 
 
931 aa  658    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.405798  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0716  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.43 
 
 
896 aa  635    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.8642e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1260  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.9 
 
 
898 aa  659    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07730  alpha-ketoglutarate decarboxylase  43.09 
 
 
1236 aa  650    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0739181  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4170  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  41.58 
 
 
1294 aa  635    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2487  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  42.28 
 
 
1267 aa  650    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0566  alpha-ketoglutarate decarboxylase  41.7 
 
 
1214 aa  656    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.622687  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3690  alpha-ketoglutarate decarboxylase  42.14 
 
 
1270 aa  638    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222337  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4070  alpha-ketoglutarate decarboxylase  42.09 
 
 
1237 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.102403 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2940  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.95 
 
 
907 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000647014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2769  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.94 
 
 
896 aa  680    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3681  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  41.82 
 
 
1219 aa  640    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6253  alpha-ketoglutarate decarboxylase  41.65 
 
 
1242 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536296  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1883  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  41.67 
 
 
1308 aa  653    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1635  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.17 
 
 
901 aa  640    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0550573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2379  alpha-ketoglutarate decarboxylase  41.94 
 
 
1266 aa  640    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000839515 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19420  alpha-ketoglutarate decarboxylase  44.41 
 
 
1317 aa  676    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.673379  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3973  alpha-ketoglutarate decarboxylase  40.64 
 
 
1269 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11274  alpha-ketoglutarate decarboxylase  41.02 
 
 
1231 aa  638    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0466625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2645  alpha-ketoglutarate decarboxylase  42.03 
 
 
1277 aa  635    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0586  alpha-ketoglutarate decarboxylase  42.42 
 
 
1233 aa  652    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.577894  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18450  alpha-ketoglutarate decarboxylase  43.06 
 
 
1303 aa  666    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0618505  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4047  alpha-ketoglutarate decarboxylase  40.64 
 
 
1269 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8284  alpha-ketoglutarate decarboxylase  42.14 
 
 
1241 aa  632  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341071  normal  0.729209 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1228  alpha-ketoglutarate decarboxylase  42.3 
 
 
1287 aa  632  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.898222  normal  0.0783656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30580  alpha-ketoglutarate decarboxylase  41.36 
 
 
1251 aa  633  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303495  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4477  alpha-ketoglutarate decarboxylase  40.64 
 
 
1262 aa  634  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.655001  normal  0.23332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3675  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  41.82 
 
 
1229 aa  633  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2890  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  42.26 
 
 
1219 aa  632  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.313836  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3987  alpha-ketoglutarate decarboxylase  40.52 
 
 
1264 aa  635  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439029  normal  0.370702 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1219  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  40.3 
 
 
1250 aa  630  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.56639  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2370  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  39.87 
 
 
1220 aa  629  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.604296  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1806  alpha-ketoglutarate decarboxylase  41.21 
 
 
1258 aa  630  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09540  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.84 
 
 
1283 aa  629  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4190  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  39.2 
 
 
920 aa  629  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133168  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2218  alpha-ketoglutarate decarboxylase  39.8 
 
 
1283 aa  624  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1428  alpha-ketoglutarate decarboxylase  39.61 
 
 
1313 aa  622  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.44598  normal  0.8951 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1274  alpha-ketoglutarate decarboxylase  43.36 
 
 
1294 aa  622  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306408  normal  0.246793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1952  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.4 
 
 
937 aa  620  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1211  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  39.43 
 
 
1239 aa  620  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191294  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0255  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40 
 
 
912 aa  616  1e-175  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0124838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3547  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.84 
 
 
901 aa  619  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1213  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.48 
 
 
987 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326546  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0832  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.22 
 
 
912 aa  612  9.999999999999999e-175  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2504  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.77 
 
 
1018 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0829  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.04 
 
 
939 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.635119  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5146  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 subunit  40.02 
 
 
1225 aa  615  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.449932 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0833  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.04 
 
 
939 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1737  alpha-ketoglutarate decarboxylase  40.3 
 
 
1263 aa  615  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.765927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7565  alpha-ketoglutarate decarboxylase  41.63 
 
 
1131 aa  609  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258386  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0846  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.09 
 
 
938 aa  610  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0077  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.86 
 
 
987 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0119842  normal  0.790423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3607  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.4 
 
 
1006 aa  611  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0522268 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0965  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.77 
 
 
992 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2625  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.77 
 
 
987 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.835957  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1732  alpha-ketoglutarate decarboxylase  40.86 
 
 
1277 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.925141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6126  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  38.18 
 
 
922 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1454  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.91 
 
 
1083 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0597  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.63 
 
 
936 aa  602  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0578  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.75 
 
 
936 aa  602  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3748  alpha-ketoglutarate decarboxylase  40.8 
 
 
1244 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0278  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.86 
 
 
985 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2941  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.18 
 
 
998 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196108  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004112  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.95 
 
 
941 aa  605  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0395  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.64 
 
 
985 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25918 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1256  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.31 
 
 
924 aa  603  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1298  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.88 
 
 
970 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.488801  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1180  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.27 
 
 
950 aa  602  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0191  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.39 
 
 
991 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4122  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.59 
 
 
998 aa  600  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0544  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.79 
 
 
985 aa  602  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.898698  normal  0.505126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0542  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.35 
 
 
989 aa  602  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2817  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.91 
 
 
994 aa  600  1e-170  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.900682  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0025  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.91 
 
 
999 aa  599  1e-170  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0156  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.3 
 
 
984 aa  600  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1673  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.89 
 
 
936 aa  597  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2503  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.33 
 
 
943 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858572  normal  0.126982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4994  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  41.34 
 
 
952 aa  597  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01355  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40 
 
 
941 aa  596  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1190  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.67 
 
 
954 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.977628  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0781  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.24 
 
 
939 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0981915  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0795  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.57 
 
 
933 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0976096  normal  0.0357723 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02000  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  39.31 
 
 
920 aa  596  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.995655  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3681  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.46 
 
 
994 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.979305 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0555  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.29 
 
 
988 aa  598  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0848498  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2910  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  37.54 
 
 
933 aa  593  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.644532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0818  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.54 
 
 
933 aa  593  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.919234  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1000  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.66 
 
 
954 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0848692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1772  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.66 
 
 
954 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537135  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0769  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.46 
 
 
933 aa  595  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2914  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38 
 
 
935 aa  593  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1750  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.66 
 
 
954 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0773  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.54 
 
 
933 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1430  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.68 
 
 
954 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0752  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  37.54 
 
 
933 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0166  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.66 
 
 
954 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.673869  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00674  hypothetical protein  37.54 
 
 
933 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>