More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0050 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0050  elongation factor Ts  100 
 
 		 282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.328781  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  41.52 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  38.25 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  41.18 
 
 		 294 aa  191  8e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  40.64 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  39.43 
 
 		 303 aa  185  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  38.04 
 
 		 303 aa  181  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  39.92 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  38.41 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  37.41 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  37.72 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  36.97 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  40.38 
 
 		 294 aa  178  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  37.06 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  34.95 
 
 		 288 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  39.15 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  35.99 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  36.27 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  36.3 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  37.14 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  37.28 
 
 		 269 aa  172  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  36.65 
 
 		 290 aa  171  9e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  37.81 
 
 		 276 aa  171  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  37.89 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  38.13 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  40.54 
 
 		 273 aa  171  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  37.81 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  35.21 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  36.49 
 
 		 287 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  38.14 
 
 		 308 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  37.11 
 
 		 288 aa  168  9e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  36.14 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  36.69 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  36.77 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  35.69 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  35.96 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  35.69 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  37.19 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  35.96 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  34.6 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  32.86 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  38.85 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  36.2 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  34.12 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  36.21 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  35.89 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  37.01 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  34.13 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1147  elongation factor Ts  36.14 
 
 		 287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4185  elongation factor Ts  36.14 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  35.62 
 
 		 308 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1592  elongation factor Ts  35.79 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  35.94 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  36 
 
 		 291 aa  162  6e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  32.99 
 
 		 276 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4081  elongation factor Ts  36.14 
 
 		 287 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  36.3 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  34.02 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  36.18 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  33.22 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  35.05 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  36.59 
 
 		 289 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  35.07 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  35.59 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  35.59 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  35.59 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  35.59 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  35.59 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  35.09 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  35.54 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  35.42 
 
 		 285 aa  159  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  37.11 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0515  elongation factor Ts  34.74 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  35 
 
 		 295 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  37.05 
 
 		 290 aa  159  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  37.26 
 
 		 291 aa  158  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  38.22 
 
 		 292 aa  158  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  35.23 
 
 		 295 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  35.17 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  34.15 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  35.23 
 
 		 295 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0516  elongation factor Ts  38.04 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.203151  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  33.56 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  34.98 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  31.97 
 
 		 313 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  35.86 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  35.46 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  34.88 
 
 		 295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  34.71 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  35.46 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  34.88 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  35.52 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  35.52 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  37.41 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  35.09 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  34.59 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  33.68 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1484  elongation factor Ts  35.89 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17070  elongation factor Ts  35.89 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  35.05 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>