153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0284 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0284  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  100 
 
 		 102 aa  201  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3758  microcompartments protein  59.41 
 
 		 103 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4709  microcompartments protein  60.4 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000189639  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2158  microcompartments protein  58.42 
 
 		 101 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.714237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2157  microcompartments protein  56.57 
 
 		 115 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727521 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1885  microcompartments protein  52.48 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1859  microcompartments protein  52.48 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0285  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  55.1 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4329  microcompartments protein  55.1 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1421  putative carboxysome assembly protein  51.49 
 
 		 102 aa  103  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00194265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3852  microcompartments protein  50.98 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1373  microcompartments protein  50.98 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1621  microcompartments protein  50.98 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.540022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1618  microcompartments protein  51.96 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1596  microcompartments protein  50.98 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4710  microcompartments protein  50 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000470001  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4472  microcompartments protein  50.98 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1865  microcompartments protein  50.98 
 
 		 102 aa  100  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1372  microcompartments protein  49.02 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4471  microcompartments protein  48.51 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1864  microcompartments protein  48.51 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1617  microcompartments protein  49.5 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3851  microcompartments protein  47.52 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.919315  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4328  microcompartments protein  54.46 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1622  microcompartments protein  47.52 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.392894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1597  microcompartments protein  47.52 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1371  microcompartments protein  46.53 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1886  microcompartments protein  56.12 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1860  microcompartments protein  56.12 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3759  microcompartments protein  49.49 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2087  microcompartments protein  43.81 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2386  microcompartments protein  41.05 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3906  microcompartments protein  41.3 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2748  microcompartments protein  40.91 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1741  microcompartments protein  42.86 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1613  microcompartments protein  39 
 
 		 256 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0812  microcompartments protein  42.05 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1860  microcompartments protein  37.63 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.864195  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0785  microcompartments protein  42.05 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4467  microcompartments protein  39.77 
 
 		 260 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5815  microcompartments protein  41.49 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588526  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3280  carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein-like  38.64 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3846  microcompartments protein  39.6 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0700872 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1415  microcompartments protein  44.3 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1359  microcompartments protein  36.78 
 
 		 202 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1425  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmO  32.63 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.125275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3281  microcompartments protein  37.21 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0210  microcompartments protein  37.93 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1749  microcompartments protein  42.53 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4907  microcompartments protein  38.71 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0846  microcompartments protein  39 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.705966  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1355  microcompartments protein  36.59 
 
 		 198 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.431976  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1981  carboxysome structural polypeptide  38.89 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0844  microcompartments protein  38.89 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.605496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0845  microcompartments protein  38.89 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3264  microcompartments protein  43.68 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2647  major carboxysome shell protein 1C (carbon dioxide concentrating mechanism protein)  40 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1878  carboxysome shell protein CsoS1  40.7 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0075  microcompartments protein  43.68 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1615  carboxysome shell peptide, CsoS1  40.7 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0557247  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0751  carboxysome shell peptide, CsoS1  40.7 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0914  microcompartments protein  38.64 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0549  carboxysome shell protein CsoS1  40.7 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06051  carboxysome shell protein CsoS1  40.7 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0748449  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06131  carboxysome shell protein CsoS1  37.37 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.172754  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06031  carboxysome shell protein CsoS1  40.7 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.207245  normal  0.289857 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08071  carboxysome shell protein CsoS1  40.7 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05751  carboxysome shell protein CsoS1  40.7 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05511  carboxysome shell protein CsoS1  40.7 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1368  microcompartments protein  41.11 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02348  predicted carboxysome structural protein, ethanolamine utilization protein  36.08 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1213  microcompartments protein  36.08 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0124  microcompartments protein  38.64 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0126  microcompartments protein  38.64 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1232  microcompartments protein  39.33 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0916  microcompartments protein  38.64 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02310  hypothetical protein  36.08 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2586  ethanolamine utilization protein EutM  36.08 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0125  microcompartments protein  38.64 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2734  ethanolamine utilization protein EutM  36.08 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1955  microcompartments protein  40.23 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2603  ethanolamine utilization protein EutM  36.08 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2823  ethanolamine utilization protein EutM  36.08 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0915  microcompartments protein  38.64 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3678  ethanolamine utilization protein EutM  36.08 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2645  carboxysome shell protein CsoS1A  38.95 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2646  carboxysome shell protein, CsoS1C  38.64 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3284  carbon dioxide concentrating mechanism protein (PduA related)-like  33.33 
 
 		 208 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1683  carboxysome shell peptide  37.5 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373595  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4338  carboxysome structural polypeptide  38.64 
 
 		 99 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1220  microcompartments protein  37.23 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1381  microcompartments protein  37.5 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.640555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1382  microcompartments protein  37.5 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2644  carboxysome structural peptide CsoS1B  38.64 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1233  microcompartments protein  37.76 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1684  carboxysome shell peptide  37.5 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0610381  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0758  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  39.08 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.531252  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1685  carboxysome shell peptide  36.36 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0523027  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0905  microcompartments protein  37.23 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196453  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3197  carboxysome shell protein, CsoS1C  36.36 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>