149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2158 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2158  microcompartments protein  100 
 
 		 101 aa  199  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.714237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1885  microcompartments protein  83.17 
 
 		 102 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1859  microcompartments protein  83.17 
 
 		 102 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4709  microcompartments protein  65.35 
 
 		 103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000189639  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3758  microcompartments protein  61.39 
 
 		 103 aa  127  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4328  microcompartments protein  71.29 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1421  putative carboxysome assembly protein  58.42 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00194265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1373  microcompartments protein  57.43 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1621  microcompartments protein  57.43 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.540022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1596  microcompartments protein  57.43 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3852  microcompartments protein  56.44 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1372  microcompartments protein  54.46 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4472  microcompartments protein  56.44 
 
 		 102 aa  105  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1865  microcompartments protein  55.45 
 
 		 102 aa  104  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4471  microcompartments protein  52.48 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4710  microcompartments protein  52.53 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000470001  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1622  microcompartments protein  53.47 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.392894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1597  microcompartments protein  53.47 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1618  microcompartments protein  54.46 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0284  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  58.42 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0285  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  50.51 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3851  microcompartments protein  51.49 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.919315  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1864  microcompartments protein  52.48 
 
 		 114 aa  101  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1617  microcompartments protein  53.47 
 
 		 113 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1371  microcompartments protein  53.47 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4329  microcompartments protein  48.48 
 
 		 118 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2157  microcompartments protein  47.96 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727521 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3759  microcompartments protein  52.53 
 
 		 116 aa  93.6  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2087  microcompartments protein  41.9 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1860  microcompartments protein  47.06 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1886  microcompartments protein  47.06 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2386  microcompartments protein  40.66 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5815  microcompartments protein  40.82 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588526  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1749  microcompartments protein  45.45 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1741  microcompartments protein  43.33 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3906  microcompartments protein  41.3 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1425  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmO  39.08 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.125275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2748  microcompartments protein  38.64 
 
 		 271 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4467  microcompartments protein  38.64 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1613  microcompartments protein  36.63 
 
 		 256 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1860  microcompartments protein  36.17 
 
 		 262 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.864195  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0210  microcompartments protein  34.41 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0812  microcompartments protein  35.23 
 
 		 270 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0785  microcompartments protein  35.23 
 
 		 270 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3281  microcompartments protein  36.17 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3846  microcompartments protein  36.36 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0700872 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1415  microcompartments protein  37.93 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4907  microcompartments protein  38.55 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2222  propanediol utilization protein PduJ  38.89 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.68551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2268  propanediol utilization protein PduJ  38.89 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.739069  normal  0.0436831 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2215  propanediol utilization protein PduJ  38.89 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2168  propanediol utilization protein PduJ  38.89 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2381  propanediol utilization protein PduJ  38.89 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1355  microcompartments protein  31.03 
 
 		 198 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.431976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3280  carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein-like  35.23 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2279  propanediol utilization protein PduA  38.71 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176891  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2215  propanediol utilization protein PduA  39.77 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2261  propanediol utilization protein PduA  39.77 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.558848  normal  0.158414 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1368  microcompartments protein  38.89 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2208  propanediol utilization protein PduA  39.77 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2161  propanediol utilization protein PduA  39.77 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2374  propanediol utilization protein PduA  39.77 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1233  microcompartments protein  34.07 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2286  propanediol utilization protein PduJ  40 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0905  microcompartments protein  38.64 
 
 		 98 aa  50.1  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196453  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3278  microcompartment protein  39.33 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1232  microcompartments protein  35.16 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1182  microcompartments protein  37.78 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0501  putative carboxysome structural-like protein  40.23 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1955  microcompartments protein  38.64 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1359  microcompartments protein  31.91 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1043  microcompartments protein  39.77 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1039  microcompartments protein  39.77 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0205  microcompartments protein  38.78 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3284  carbon dioxide concentrating mechanism protein (PduA related)-like  32.91 
 
 		 208 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1168  microcompartments protein  37.5 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2641  microcompartments protein  37.5 
 
 		 96 aa  47.4  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4097  microcompartments protein  37.5 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0908  microcompartments protein  37.5 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3264  microcompartments protein  36.36 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2287  propanediol utilization protein PduK  27.59 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1181  microcompartments protein  31.52 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1411  microcompartments protein  38.89 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02348  predicted carboxysome structural protein, ethanolamine utilization protein  35.96 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1213  microcompartments protein  35.96 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3270  ethanolamine utilization protein eutM precursor  37.78 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2273  microcompartments protein  38.1 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.19375  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0075  microcompartments protein  38.64 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2586  ethanolamine utilization protein EutM  35.96 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2734  ethanolamine utilization protein EutM  35.96 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1186  microcompartments protein  29.7 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2603  ethanolamine utilization protein EutM  35.96 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2823  ethanolamine utilization protein EutM  35.96 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02310  hypothetical protein  35.96 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3678  ethanolamine utilization protein EutM  35.96 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1220  microcompartments protein  35.96 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0844  microcompartments protein  37.08 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.605496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0845  microcompartments protein  37.08 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4890  microcompartments protein  35.56 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1684  carboxysome shell peptide  37.36 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0610381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>