218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0908 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0908  microcompartments protein  100 
 
 		 92 aa  178  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1168  microcompartments protein  95.65 
 
 		 93 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0210  microcompartments protein  74.16 
 
 		 100 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1749  microcompartments protein  67.39 
 
 		 93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1741  microcompartments protein  72.94 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0905  microcompartments protein  76.67 
 
 		 98 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4097  microcompartments protein  77.53 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3264  microcompartments protein  76.74 
 
 		 95 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1955  microcompartments protein  77.53 
 
 		 93 aa  120  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2261  propanediol utilization protein PduA  76.4 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.558848  normal  0.158414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2374  propanediol utilization protein PduA  76.4 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2161  propanediol utilization protein PduA  76.4 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2208  propanediol utilization protein PduA  76.4 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2215  propanediol utilization protein PduA  76.4 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1182  microcompartments protein  71.91 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2279  propanediol utilization protein PduA  75.28 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176891  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2268  propanediol utilization protein PduJ  79.07 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.739069  normal  0.0436831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2381  propanediol utilization protein PduJ  79.07 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2222  propanediol utilization protein PduJ  79.07 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.68551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2641  microcompartments protein  74.71 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2215  propanediol utilization protein PduJ  79.07 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2168  propanediol utilization protein PduJ  79.07 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1411  microcompartments protein  74.44 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1368  microcompartments protein  74.42 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4890  microcompartments protein  75.58 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4030  microcompartments protein  77.65 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0075  microcompartments protein  75 
 
 		 99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1039  microcompartments protein  76.74 
 
 		 91 aa  114  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3278  microcompartment protein  71.11 
 
 		 94 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2286  propanediol utilization protein PduJ  77.01 
 
 		 91 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1430  microcompartments protein  71.91 
 
 		 94 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3270  ethanolamine utilization protein eutM precursor  75.29 
 
 		 92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1043  microcompartments protein  76.47 
 
 		 97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1165  microcompartments protein  78.89 
 
 		 97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.128739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0357  microcompartments protein  72.22 
 
 		 96 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0896  ethanolamine utilization protein EutM  69.32 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0358  microcompartments protein  71.91 
 
 		 92 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0501  putative carboxysome structural-like protein  74.12 
 
 		 105 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5815  microcompartments protein  61.63 
 
 		 99 aa  110  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588526  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1299  microcompartments protein  73.26 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1038  microcompartments protein  75.29 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2645  carboxysome shell protein CsoS1A  64.44 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4907  microcompartments protein  57.78 
 
 		 96 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2646  carboxysome shell protein, CsoS1C  63.33 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1684  carboxysome shell peptide  63.33 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0610381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1382  microcompartments protein  63.33 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0126  microcompartments protein  63.33 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0125  microcompartments protein  63.33 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0124  microcompartments protein  63.33 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0205  microcompartments protein  70.93 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1685  carboxysome shell peptide  62.22 
 
 		 98 aa  104  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0523027  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1683  carboxysome shell peptide  63.33 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373595  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1381  microcompartments protein  63.33 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.640555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1383  microcompartments protein  62.22 
 
 		 98 aa  104  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0916  microcompartments protein  62.22 
 
 		 98 aa  103  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0915  microcompartments protein  62.22 
 
 		 98 aa  103  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0866  microcompartments protein  62.22 
 
 		 104 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.457489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3197  carboxysome shell protein, CsoS1C  62.92 
 
 		 99 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3195  carboxysome structural peptide CsoS1B  62.22 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3281  microcompartments protein  56.98 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3196  carboxysome structural peptide CsoS1B  62.92 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.446917  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2644  carboxysome structural peptide CsoS1B  62.92 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4472  microcompartments protein  59.77 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4338  carboxysome structural polypeptide  63.33 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1232  microcompartments protein  66.28 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0865  microcompartments protein  61.8 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1878  carboxysome shell protein CsoS1  63.74 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1980  carboxysome structural peptide CsoS1B  62.22 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0864  microcompartments protein  61.8 
 
 		 99 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.465845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1615  carboxysome shell peptide, CsoS1  63.74 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0557247  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0751  carboxysome shell peptide, CsoS1  63.74 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06031  carboxysome shell protein CsoS1  63.74 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.207245  normal  0.289857 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05511  carboxysome shell protein CsoS1  63.74 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0549  carboxysome shell protein CsoS1  63.74 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1233  microcompartments protein  63.95 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06051  carboxysome shell protein CsoS1  63.74 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0748449  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06131  carboxysome shell protein CsoS1  63.74 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.172754  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08071  carboxysome shell protein CsoS1  63.74 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05751  carboxysome shell protein CsoS1  63.74 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2647  major carboxysome shell protein 1C (carbon dioxide concentrating mechanism protein)  59.34 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4339  carboxysome structural peptide CsoS1B  61.11 
 
 		 115 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1373  microcompartments protein  58.62 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0758  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  59.55 
 
 		 178 aa  100  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.531252  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1865  microcompartments protein  58.62 
 
 		 102 aa  100  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1621  microcompartments protein  58.62 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.540022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1981  carboxysome structural polypeptide  63.64 
 
 		 98 aa  100  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3852  microcompartments protein  57.47 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1596  microcompartments protein  58.62 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02348  predicted carboxysome structural protein, ethanolamine utilization protein  62.79 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1213  microcompartments protein  62.79 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0844  microcompartments protein  62.07 
 
 		 96 aa  99.4  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.605496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0845  microcompartments protein  62.07 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0846  microcompartments protein  62.07 
 
 		 102 aa  99.4  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.705966  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02310  hypothetical protein  62.79 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0914  microcompartments protein  62.5 
 
 		 110 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2823  ethanolamine utilization protein EutM  62.79 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2603  ethanolamine utilization protein EutM  62.79 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3678  ethanolamine utilization protein EutM  62.79 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2586  ethanolamine utilization protein EutM  62.79 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2734  ethanolamine utilization protein EutM  62.79 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>