211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1371 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1371  microcompartments protein  100 
 
 		 112 aa  222  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1597  microcompartments protein  94.64 
 
 		 111 aa  208  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1622  microcompartments protein  94.64 
 
 		 111 aa  208  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.392894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1617  microcompartments protein  89.29 
 
 		 113 aa  193  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1864  microcompartments protein  92.38 
 
 		 114 aa  191  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4471  microcompartments protein  91.43 
 
 		 114 aa  190  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1372  microcompartments protein  94.06 
 
 		 103 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3851  microcompartments protein  89.32 
 
 		 112 aa  186  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.919315  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1621  microcompartments protein  91.09 
 
 		 103 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.540022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1373  microcompartments protein  91.09 
 
 		 103 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1596  microcompartments protein  91.09 
 
 		 103 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1618  microcompartments protein  91.09 
 
 		 102 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1865  microcompartments protein  91.09 
 
 		 102 aa  180  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4472  microcompartments protein  90.1 
 
 		 102 aa  178  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1421  putative carboxysome assembly protein  89.11 
 
 		 102 aa  179  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00194265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3852  microcompartments protein  88.12 
 
 		 103 aa  176  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4710  microcompartments protein  63.46 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000470001  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2386  microcompartments protein  55.05 
 
 		 111 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3759  microcompartments protein  62.04 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4329  microcompartments protein  54.9 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3758  microcompartments protein  53.47 
 
 		 103 aa  105  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0210  microcompartments protein  54.08 
 
 		 100 aa  103  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2157  microcompartments protein  49.09 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2087  microcompartments protein  56.19 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2158  microcompartments protein  53.47 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.714237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0285  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  51 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1885  microcompartments protein  53.47 
 
 		 102 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1859  microcompartments protein  53.47 
 
 		 102 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4709  microcompartments protein  50.5 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000189639  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5815  microcompartments protein  51.52 
 
 		 99 aa  95.1  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588526  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1741  microcompartments protein  56.67 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1182  microcompartments protein  60.92 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3281  microcompartments protein  50.55 
 
 		 96 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4907  microcompartments protein  52.33 
 
 		 96 aa  89.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1368  microcompartments protein  57.78 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1860  microcompartments protein  47.42 
 
 		 262 aa  88.6  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.864195  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1860  microcompartments protein  56.12 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1886  microcompartments protein  56.12 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4097  microcompartments protein  58.62 
 
 		 93 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1233  microcompartments protein  52.04 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2374  propanediol utilization protein PduA  60.92 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2215  propanediol utilization protein PduA  60.92 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2208  propanediol utilization protein PduA  60.92 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2161  propanediol utilization protein PduA  60.92 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2261  propanediol utilization protein PduA  60.92 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.558848  normal  0.158414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4467  microcompartments protein  46.94 
 
 		 260 aa  87.8  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2279  propanediol utilization protein PduA  59.77 
 
 		 94 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176891  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0905  microcompartments protein  56.32 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196453  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1749  microcompartments protein  54.02 
 
 		 93 aa  87  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1038  microcompartments protein  59.77 
 
 		 91 aa  87  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1613  microcompartments protein  48 
 
 		 256 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2381  propanediol utilization protein PduJ  58.89 
 
 		 91 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2215  propanediol utilization protein PduJ  58.89 
 
 		 91 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2268  propanediol utilization protein PduJ  58.89 
 
 		 91 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.739069  normal  0.0436831 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2222  propanediol utilization protein PduJ  58.89 
 
 		 91 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.68551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2168  propanediol utilization protein PduJ  58.89 
 
 		 91 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3906  microcompartments protein  56.52 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4030  microcompartments protein  57.95 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1232  microcompartments protein  52.75 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1955  microcompartments protein  59.77 
 
 		 93 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1168  microcompartments protein  59.77 
 
 		 93 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3264  microcompartments protein  53.85 
 
 		 95 aa  84.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2748  microcompartments protein  47 
 
 		 271 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1043  microcompartments protein  58.62 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0908  microcompartments protein  58.62 
 
 		 92 aa  84  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4328  microcompartments protein  56.44 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1039  microcompartments protein  58.62 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02348  predicted carboxysome structural protein, ethanolamine utilization protein  54.55 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1213  microcompartments protein  54.55 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3270  ethanolamine utilization protein eutM precursor  56.52 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02310  hypothetical protein  54.55 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2823  ethanolamine utilization protein EutM  54.55 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2586  ethanolamine utilization protein EutM  54.55 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3678  ethanolamine utilization protein EutM  54.55 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2734  ethanolamine utilization protein EutM  54.55 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1220  microcompartments protein  54.55 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2603  ethanolamine utilization protein EutM  54.55 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0812  microcompartments protein  45.92 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0205  microcompartments protein  55.1 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2647  major carboxysome shell protein 1C (carbon dioxide concentrating mechanism protein)  51.11 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2286  propanediol utilization protein PduJ  56.67 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0785  microcompartments protein  45.92 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0501  putative carboxysome structural-like protein  56.32 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0075  microcompartments protein  54.02 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2641  microcompartments protein  54.02 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3278  microcompartment protein  55.06 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4890  microcompartments protein  52.81 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3846  microcompartments protein  47.73 
 
 		 258 aa  80.9  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0700872 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1425  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmO  46.59 
 
 		 276 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.125275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1430  microcompartments protein  56.32 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1878  carboxysome shell protein CsoS1  51.69 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1615  carboxysome shell peptide, CsoS1  51.69 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0557247  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0751  carboxysome shell peptide, CsoS1  51.69 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0549  carboxysome shell protein CsoS1  51.69 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06051  carboxysome shell protein CsoS1  51.69 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0748449  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06131  carboxysome shell protein CsoS1  51.69 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.172754  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06031  carboxysome shell protein CsoS1  51.69 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.207245  normal  0.289857 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08071  carboxysome shell protein CsoS1  51.69 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05751  carboxysome shell protein CsoS1  51.69 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05511  carboxysome shell protein CsoS1  51.69 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>