199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2748 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2748  microcompartments protein  100 
 
 
271 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0812  microcompartments protein  77.44 
 
 
270 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0785  microcompartments protein  77.44 
 
 
270 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3846  microcompartments protein  64.34 
 
 
258 aa  318  6e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0700872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4467  microcompartments protein  66.8 
 
 
260 aa  311  7.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625147  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1860  microcompartments protein  66.67 
 
 
262 aa  300  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.864195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1613  microcompartments protein  64.66 
 
 
256 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1425  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmO  56.22 
 
 
276 aa  254  9e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.125275  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1355  microcompartments protein  37.3 
 
 
198 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.431976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3284  carbon dioxide concentrating mechanism protein (PduA related)-like  38.31 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1373  microcompartments protein  47.06 
 
 
103 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1596  microcompartments protein  47.06 
 
 
103 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1621  microcompartments protein  47.06 
 
 
103 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.540022  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3852  microcompartments protein  46.08 
 
 
103 aa  89.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5815  microcompartments protein  46.59 
 
 
99 aa  88.6  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588526  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1372  microcompartments protein  47.06 
 
 
103 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1622  microcompartments protein  48 
 
 
111 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.392894  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4472  microcompartments protein  47 
 
 
102 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.518185  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1597  microcompartments protein  48 
 
 
111 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1421  putative carboxysome assembly protein  46 
 
 
102 aa  87  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00194265  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1865  microcompartments protein  46 
 
 
102 aa  86.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4471  microcompartments protein  47 
 
 
114 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261458  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1617  microcompartments protein  46 
 
 
113 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1864  microcompartments protein  47 
 
 
114 aa  85.5  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1618  microcompartments protein  47.73 
 
 
102 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3851  microcompartments protein  46 
 
 
112 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.919315  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0210  microcompartments protein  43.75 
 
 
100 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1371  microcompartments protein  47 
 
 
112 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1220  microcompartments protein  44.76 
 
 
111 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1741  microcompartments protein  44.44 
 
 
96 aa  80.9  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02348  predicted carboxysome structural protein, ethanolamine utilization protein  48.31 
 
 
97 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1213  microcompartments protein  48.31 
 
 
97 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02310  hypothetical protein  48.31 
 
 
97 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2823  ethanolamine utilization protein EutM  48.31 
 
 
97 aa  80.5  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1233  microcompartments protein  47.25 
 
 
125 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2586  ethanolamine utilization protein EutM  48.31 
 
 
97 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2734  ethanolamine utilization protein EutM  48.31 
 
 
97 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3678  ethanolamine utilization protein EutM  48.31 
 
 
97 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2603  ethanolamine utilization protein EutM  48.31 
 
 
97 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2386  microcompartments protein  45.74 
 
 
111 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4710  microcompartments protein  40 
 
 
117 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000470001  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3281  microcompartments protein  40.7 
 
 
96 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1232  microcompartments protein  47.73 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4907  microcompartments protein  44.19 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1749  microcompartments protein  43.53 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3264  microcompartments protein  44.94 
 
 
95 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2208  propanediol utilization protein PduA  47.19 
 
 
94 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151925  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2215  propanediol utilization protein PduA  47.19 
 
 
94 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2374  propanediol utilization protein PduA  47.19 
 
 
94 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2261  propanediol utilization protein PduA  47.19 
 
 
94 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.558848  normal  0.158414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2161  propanediol utilization protein PduA  47.19 
 
 
94 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0908  microcompartments protein  52.94 
 
 
92 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2279  propanediol utilization protein PduA  47.19 
 
 
94 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176891  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1043  microcompartments protein  47.31 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1039  microcompartments protein  48.84 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2168  propanediol utilization protein PduJ  47.13 
 
 
91 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2381  propanediol utilization protein PduJ  47.13 
 
 
91 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2222  propanediol utilization protein PduJ  47.13 
 
 
91 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.68551  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2215  propanediol utilization protein PduJ  47.13 
 
 
91 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2268  propanediol utilization protein PduJ  47.13 
 
 
91 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.739069  normal  0.0436831 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1038  microcompartments protein  48.84 
 
 
91 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1168  microcompartments protein  50.59 
 
 
93 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4908  microcompartments protein  48.1 
 
 
98 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4097  microcompartments protein  47.73 
 
 
93 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1182  microcompartments protein  50.59 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2087  microcompartments protein  41.94 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0905  microcompartments protein  46.67 
 
 
98 aa  70.5  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196453  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3286  microcompartments protein  46.84 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4030  microcompartments protein  45.88 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2641  microcompartments protein  41.57 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0285  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  37.08 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4890  microcompartments protein  42.22 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1430  microcompartments protein  45.35 
 
 
94 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1955  microcompartments protein  42.86 
 
 
93 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3270  ethanolamine utilization protein eutM precursor  45.35 
 
 
92 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3278  microcompartment protein  42.7 
 
 
94 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1859  microcompartments protein  38.64 
 
 
102 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1885  microcompartments protein  38.64 
 
 
102 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2286  propanediol utilization protein PduJ  47.13 
 
 
91 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3759  microcompartments protein  39 
 
 
116 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0501  putative carboxysome structural-like protein  47.06 
 
 
105 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4329  microcompartments protein  39.77 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356028  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0205  microcompartments protein  45.45 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1368  microcompartments protein  43.82 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1411  microcompartments protein  44.19 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1293  microcompartments protein  46.74 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542399  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0896  ethanolamine utilization protein EutM  44.32 
 
 
96 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1299  microcompartments protein  37.63 
 
 
95 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4709  microcompartments protein  39.77 
 
 
103 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000189639  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1756  microcompartments protein  46.59 
 
 
96 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.280732  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3758  microcompartments protein  38.64 
 
 
103 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2158  microcompartments protein  38.64 
 
 
101 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.714237 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0075  microcompartments protein  43.53 
 
 
99 aa  63.9  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2157  microcompartments protein  36.36 
 
 
115 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727521 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1685  carboxysome shell peptide  38.04 
 
 
98 aa  62.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0523027  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1383  microcompartments protein  38.04 
 
 
98 aa  62.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1878  carboxysome shell protein CsoS1  38.38 
 
 
103 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06031  carboxysome shell protein CsoS1  38.38 
 
 
103 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.207245  normal  0.289857 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1684  carboxysome shell peptide  36.96 
 
 
100 aa  62.4  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0610381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0914  microcompartments protein  39.13 
 
 
110 aa  62.4  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>