219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2222 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2268  propanediol utilization protein PduJ  100 
 
 
91 aa  176  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.739069  normal  0.0436831 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2215  propanediol utilization protein PduJ  100 
 
 
91 aa  176  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2168  propanediol utilization protein PduJ  100 
 
 
91 aa  176  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2381  propanediol utilization protein PduJ  100 
 
 
91 aa  176  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2222  propanediol utilization protein PduJ  100 
 
 
91 aa  176  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.68551  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2286  propanediol utilization protein PduJ  97.8 
 
 
91 aa  149  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0210  microcompartments protein  75.86 
 
 
100 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1741  microcompartments protein  76.14 
 
 
96 aa  132  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0905  microcompartments protein  81.82 
 
 
98 aa  128  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196453  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2374  propanediol utilization protein PduA  82.95 
 
 
94 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2208  propanediol utilization protein PduA  82.95 
 
 
94 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151925  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0205  microcompartments protein  81.82 
 
 
96 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2161  propanediol utilization protein PduA  82.95 
 
 
94 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2261  propanediol utilization protein PduA  82.95 
 
 
94 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.558848  normal  0.158414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2215  propanediol utilization protein PduA  82.95 
 
 
94 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2279  propanediol utilization protein PduA  81.82 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3264  microcompartments protein  80.46 
 
 
95 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4097  microcompartments protein  82.02 
 
 
93 aa  123  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3270  ethanolamine utilization protein eutM precursor  75.82 
 
 
92 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1749  microcompartments protein  71.26 
 
 
93 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0501  putative carboxysome structural-like protein  81.4 
 
 
105 aa  121  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1368  microcompartments protein  75.28 
 
 
94 aa  120  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0896  ethanolamine utilization protein EutM  77.27 
 
 
96 aa  120  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1955  microcompartments protein  81.82 
 
 
93 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2641  microcompartments protein  76.4 
 
 
96 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1043  microcompartments protein  77.27 
 
 
97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4890  microcompartments protein  79.31 
 
 
95 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3278  microcompartment protein  75 
 
 
94 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0075  microcompartments protein  77.17 
 
 
99 aa  117  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1039  microcompartments protein  77.01 
 
 
91 aa  117  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1182  microcompartments protein  73.56 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0357  microcompartments protein  77.01 
 
 
96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1430  microcompartments protein  76.14 
 
 
94 aa  115  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5815  microcompartments protein  63.64 
 
 
99 aa  113  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588526  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1299  microcompartments protein  74.71 
 
 
95 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0908  microcompartments protein  79.07 
 
 
92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1168  microcompartments protein  79.07 
 
 
93 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1411  microcompartments protein  73.86 
 
 
96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4907  microcompartments protein  63.64 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4030  microcompartments protein  73.56 
 
 
104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1038  microcompartments protein  74.71 
 
 
91 aa  110  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2345  microcompartments protein  75.58 
 
 
106 aa  110  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000506972  hitchhiker  0.00332823 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0358  microcompartments protein  71.91 
 
 
92 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1232  microcompartments protein  69.32 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1165  microcompartments protein  80 
 
 
97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.128739  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3281  microcompartments protein  59.09 
 
 
96 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1361  microcompartments protein  75 
 
 
95 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1233  microcompartments protein  64.77 
 
 
125 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1865  microcompartments protein  60 
 
 
102 aa  100  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4472  microcompartments protein  60 
 
 
102 aa  100  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.518185  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1373  microcompartments protein  58.89 
 
 
103 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1621  microcompartments protein  58.89 
 
 
103 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.540022  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1596  microcompartments protein  58.89 
 
 
103 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1618  microcompartments protein  58.89 
 
 
102 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3852  microcompartments protein  57.78 
 
 
103 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4908  microcompartments protein  60.23 
 
 
98 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1622  microcompartments protein  58.89 
 
 
111 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.392894  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1421  putative carboxysome assembly protein  58.89 
 
 
102 aa  98.2  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00194265  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1597  microcompartments protein  58.89 
 
 
111 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1371  microcompartments protein  58.89 
 
 
112 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2647  major carboxysome shell protein 1C (carbon dioxide concentrating mechanism protein)  56.67 
 
 
113 aa  98.2  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1372  microcompartments protein  57.78 
 
 
103 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02348  predicted carboxysome structural protein, ethanolamine utilization protein  63.95 
 
 
97 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1213  microcompartments protein  63.95 
 
 
97 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4471  microcompartments protein  57.78 
 
 
114 aa  97.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261458  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2603  ethanolamine utilization protein EutM  63.95 
 
 
97 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02310  hypothetical protein  63.95 
 
 
97 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2823  ethanolamine utilization protein EutM  63.95 
 
 
97 aa  97.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3678  ethanolamine utilization protein EutM  63.95 
 
 
97 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2586  ethanolamine utilization protein EutM  63.95 
 
 
97 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2734  ethanolamine utilization protein EutM  63.95 
 
 
97 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1220  microcompartments protein  63.95 
 
 
111 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3286  microcompartments protein  59.09 
 
 
99 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3851  microcompartments protein  56.67 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.919315  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1683  carboxysome shell peptide  59.09 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0916  microcompartments protein  59.09 
 
 
98 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0915  microcompartments protein  59.09 
 
 
98 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3284  carbon dioxide concentrating mechanism protein (PduA related)-like  60.26 
 
 
208 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1381  microcompartments protein  59.09 
 
 
112 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.640555  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0507  propanediol utilization  64.37 
 
 
100 aa  95.5  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.543928 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1864  microcompartments protein  57.78 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1382  microcompartments protein  59.09 
 
 
98 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1981  carboxysome structural polypeptide  56.04 
 
 
98 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1684  carboxysome shell peptide  59.09 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0610381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0914  microcompartments protein  59.09 
 
 
110 aa  95.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2338  microcompartments protein  69.05 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000912502  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1617  microcompartments protein  56.67 
 
 
113 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3195  carboxysome structural peptide CsoS1B  56.82 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0866  microcompartments protein  55.68 
 
 
104 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.457489  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2645  carboxysome shell protein CsoS1A  56.82 
 
 
101 aa  94  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2646  carboxysome shell protein, CsoS1C  56.18 
 
 
99 aa  94  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3197  carboxysome shell protein, CsoS1C  56.32 
 
 
99 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1383  microcompartments protein  57.95 
 
 
98 aa  94.4  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1685  carboxysome shell peptide  57.95 
 
 
98 aa  94.4  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0523027  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0124  microcompartments protein  59.3 
 
 
103 aa  93.6  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0126  microcompartments protein  59.3 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3196  carboxysome structural peptide CsoS1B  56.32 
 
 
97 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.446917  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4338  carboxysome structural polypeptide  56.82 
 
 
99 aa  93.6  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0125  microcompartments protein  59.3 
 
 
103 aa  93.6  9e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2644  carboxysome structural peptide CsoS1B  56.98 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>