185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3906 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3906  microcompartments protein  100 
 
 		 104 aa  206  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4472  microcompartments protein  61.96 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1865  microcompartments protein  60.87 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3851  microcompartments protein  59.78 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.919315  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3852  microcompartments protein  58.7 
 
 		 103 aa  110  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1618  microcompartments protein  58.7 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1421  putative carboxysome assembly protein  56.52 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00194265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1864  microcompartments protein  57.61 
 
 		 114 aa  107  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4471  microcompartments protein  56.52 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1617  microcompartments protein  56.52 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1372  microcompartments protein  57.61 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1621  microcompartments protein  56.52 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.540022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1596  microcompartments protein  56.52 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1373  microcompartments protein  55.43 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1622  microcompartments protein  55.43 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.392894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1597  microcompartments protein  55.43 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1371  microcompartments protein  56.52 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2386  microcompartments protein  49.51 
 
 		 111 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4710  microcompartments protein  51.14 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000470001  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2087  microcompartments protein  47.42 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0846  microcompartments protein  48.42 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.705966  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0845  microcompartments protein  48.89 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0285  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  47.73 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0844  microcompartments protein  48.89 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.605496  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4709  microcompartments protein  44.57 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000189639  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1885  carboxysome shell peptide, CsoS1  47.13 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1981  carboxysome structural polypeptide  45.26 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06101  carboxysome structural protein CsoS1  47.13 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.33467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1741  microcompartments protein  45.92 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3758  microcompartments protein  43.48 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1878  carboxysome shell protein CsoS1  47.19 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1615  carboxysome shell peptide, CsoS1  47.19 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0557247  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0751  carboxysome shell peptide, CsoS1  47.19 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0549  carboxysome shell protein CsoS1  47.19 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06051  carboxysome shell protein CsoS1  47.19 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0748449  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06131  carboxysome shell protein CsoS1  47.19 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.172754  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06031  carboxysome shell protein CsoS1  47.19 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.207245  normal  0.289857 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05751  carboxysome shell protein CsoS1  47.19 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05511  carboxysome shell protein CsoS1  47.19 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0758  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  47.13 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.531252  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4329  microcompartments protein  48.31 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08071  carboxysome shell protein CsoS1  47.19 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1683  carboxysome shell peptide  45.16 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373595  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1381  microcompartments protein  45.16 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.640555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2157  microcompartments protein  44.94 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1980  carboxysome structural peptide CsoS1B  43.01 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1608  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  47.13 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1885  microcompartments protein  44.57 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1859  microcompartments protein  44.57 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4338  carboxysome structural polypeptide  45.16 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05581  hypothetical protein  47.13 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2158  microcompartments protein  41.3 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.714237 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0916  microcompartments protein  45.16 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0124  microcompartments protein  45.26 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3759  microcompartments protein  52.27 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2647  major carboxysome shell protein 1C (carbon dioxide concentrating mechanism protein)  43.27 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0915  microcompartments protein  45.16 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0126  microcompartments protein  44.21 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4339  carboxysome structural peptide CsoS1B  42.39 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0125  microcompartments protein  44.21 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5815  microcompartments protein  44.57 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588526  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3195  carboxysome structural peptide CsoS1B  41.76 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2645  carboxysome shell protein CsoS1A  44.21 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1684  carboxysome shell peptide  43.96 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0610381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1383  microcompartments protein  43.96 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0210  microcompartments protein  42.53 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1382  microcompartments protein  43.96 
 
 		 98 aa  73.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1685  carboxysome shell peptide  43.96 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0523027  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1613  microcompartments protein  45.45 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3196  carboxysome structural peptide CsoS1B  41.76 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.446917  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08151  hypothetical protein  45.65 
 
 		 91 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0914  microcompartments protein  44.57 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2646  carboxysome shell protein, CsoS1C  44.32 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0866  microcompartments protein  40.86 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.457489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2644  carboxysome structural peptide CsoS1B  44.32 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1425  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmO  38.2 
 
 		 276 aa  70.9  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.125275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0865  microcompartments protein  40.66 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1038  microcompartments protein  49.43 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3197  carboxysome shell protein, CsoS1C  42.05 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.452211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2648  major carboxysome shell protein 1A (carbon dioxide concentrating mechanism protein)  41.38 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1749  microcompartments protein  41.38 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0864  microcompartments protein  40.91 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.465845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4030  microcompartments protein  46.59 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1043  microcompartments protein  48.28 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2748  microcompartments protein  39.77 
 
 		 271 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2279  propanediol utilization protein PduA  47.83 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176891  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1039  microcompartments protein  47.13 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3846  microcompartments protein  39.77 
 
 		 258 aa  67  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0700872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1232  microcompartments protein  41.94 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2161  propanediol utilization protein PduA  47.13 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2374  propanediol utilization protein PduA  47.13 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2208  propanediol utilization protein PduA  47.13 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2261  propanediol utilization protein PduA  47.13 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.558848  normal  0.158414 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1860  microcompartments protein  40.45 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.864195  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2215  propanediol utilization protein PduA  47.13 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0785  microcompartments protein  39.77 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1299  microcompartments protein  45.05 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3281  microcompartments protein  40.7 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1955  microcompartments protein  48.28 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0812  microcompartments protein  39.77 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>