235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2509 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2509  integrase, catalytic region  100 
 
 		 112 aa  228  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.395087  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0293  integrase catalytic subunit  46.49 
 
 		 294 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0390  integrase catalytic subunit  46.49 
 
 		 294 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.50729  normal  0.30178 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0647  integrase catalytic subunit  46.49 
 
 		 294 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218142 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0902  integrase catalytic subunit  46.49 
 
 		 294 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2062  integrase catalytic subunit  46.49 
 
 		 294 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0588444 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1619  integrase catalytic region  34.17 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0064  integrase catalytic region  34.17 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3318  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 341 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3027  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 341 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2204  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 341 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4367  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 341 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4345  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 341 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3928  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 341 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1238  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 341 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0318  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 341 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  37.21 
 
 		 272 aa  50.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1645  integrase catalytic subunit  39.29 
 
 		 259 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0305  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 		 271 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.667287  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0639  IS5 family transposase orfB  28.71 
 
 		 273 aa  48.9  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1841  integrase catalytic subunit  38.55 
 
 		 301 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2069  integrase catalytic region  30.49 
 
 		 334 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291135  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01833  putative transposase  29.63 
 
 		 275 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01835  putative transposase  29.63 
 
 		 275 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02257  putative transposase  29.63 
 
 		 275 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02618  putative transposase  29.63 
 
 		 256 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0536  putative transposase  34.94 
 
 		 336 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1381  putative integrase  34.94 
 
 		 336 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3124  hypothetical protein  36.71 
 
 		 232 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.010026  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2536  Integrase catalytic region  28.95 
 
 		 325 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000616979  normal  0.891736 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1351  transposase and inactivated derivatives  33.73 
 
 		 336 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0376  Integrase catalytic region  28.95 
 
 		 325 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000454687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3821  integrase catalytic subunit  33.72 
 
 		 318 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000253663  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  26.04 
 
 		 283 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1541  integrase catalytic subunit  33.72 
 
 		 318 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3130  integrase catalytic region  32 
 
 		 347 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  24.17 
 
 		 272 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  24.73 
 
 		 290 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  24.73 
 
 		 290 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4151  integrase catalytic region  32 
 
 		 347 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  24.73 
 
 		 290 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  24.73 
 
 		 290 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  24.73 
 
 		 290 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1686  ISCps9, transposase orfB  30.91 
 
 		 295 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2857  ISCps9, transposase orfB  30.91 
 
 		 295 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0915718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2962  ISCps9, transposase orfB  30.91 
 
 		 295 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3122  ISCps9, transposase orfB  30.91 
 
 		 295 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  31.46 
 
 		 286 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  28 
 
 		 289 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1896  ISCps9, transposase orfB, truncated  30.91 
 
 		 266 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  28 
 
 		 273 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  25.81 
 
 		 275 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  25.81 
 
 		 303 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2337  integrase catalytic subunit  29.79 
 
 		 354 aa  43.5  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1848  integrase catalytic subunit  28.05 
 
 		 332 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1232  integrase catalytic subunit  28.05 
 
 		 332 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0058  integrase catalytic subunit  28.05 
 
 		 332 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0537  transposase orfAB  30.49 
 
 		 269 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0863  transposase orfAB  30.49 
 
 		 269 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200309  normal  0.704725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1453  transposase orfAB  30.49 
 
 		 269 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  25 
 
 		 275 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  25 
 
 		 275 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  25 
 
 		 275 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3414  Integrase catalytic region  26.44 
 
 		 331 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3392  Integrase catalytic region  26.44 
 
 		 327 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2329  integrase catalytic subunit  29.79 
 
 		 352 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  24.79 
 
 		 260 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  24.79 
 
 		 260 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0640  helix-turn-helix, Fis-type  28.41 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.337003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0782  integrase, catalytic region  28.41 
 
 		 237 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1018  helix-turn-helix, Fis-type  28.41 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1299  helix-turn-helix, Fis-type  28.41 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1932  helix-turn-helix, Fis-type  28.41 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1945  helix-turn-helix, Fis-type  28.41 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1964  helix-turn-helix, Fis-type  28.41 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2082  helix-turn-helix, Fis-type  28.41 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2099  helix-turn-helix, Fis-type  28.41 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2135  helix-turn-helix, Fis-type  28.41 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2329  helix-turn-helix, Fis-type  28.41 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137968  normal  0.366873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  25 
 
 		 275 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3545  integrase catalytic subunit  30.95 
 
 		 317 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2451  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 326 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.908146 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5077  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 		 266 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4906  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.350856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  22.5 
 
 		 270 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1103  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 		 364 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1517  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 		 364 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37516  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1907  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 		 364 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  decreased coverage  0.000309488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2135  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 		 364 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2427  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 		 364 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.8611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2773  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 		 364 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2875  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 		 364 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.398245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3341  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 		 364 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3660  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 		 364 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3763  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 		 364 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3792  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 		 364 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3798  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 		 364 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4357  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 		 364 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0429  integrase catalytic subunit  29.13 
 
 		 325 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  22.5 
 
 		 270 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>