204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0445 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0445  magnesium chelatase  100 
 
 		 402 aa  829    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2027  AAA ATPase  45.95 
 
 		 453 aa  322  9.000000000000001e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  30.09 
 
 		 637 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.97 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.78 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.54 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.9 
 
 		 340 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.73 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.99 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.9 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  27.81 
 
 		 689 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.76 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  27.39 
 
 		 749 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.04 
 
 		 340 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.57 
 
 		 688 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.67 
 
 		 369 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.44 
 
 		 394 aa  98.6  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  26.84 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.84 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  27.06 
 
 		 346 aa  97.8  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.75 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  26.79 
 
 		 362 aa  96.3  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.41 
 
 		 600 aa  95.9  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.23 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.58 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.39 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  26.82 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  27.08 
 
 		 362 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.92 
 
 		 379 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.22 
 
 		 383 aa  93.2  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.53 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.12 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.89 
 
 		 337 aa  92  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  26.28 
 
 		 362 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.07 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  26.28 
 
 		 362 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.47 
 
 		 348 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  26.28 
 
 		 362 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  24.75 
 
 		 346 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.6 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.2 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.39 
 
 		 673 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.39 
 
 		 673 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  33.33 
 
 		 776 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  27.72 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.47 
 
 		 373 aa  86.7  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.62 
 
 		 382 aa  86.7  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  27.21 
 
 		 372 aa  86.3  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  27.48 
 
 		 719 aa  85.9  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.38 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.38 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  25.15 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.28 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.21 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  24.61 
 
 		 788 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  26.82 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  25.6 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.49 
 
 		 672 aa  84.7  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  29.05 
 
 		 614 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.13 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.63 
 
 		 616 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  28.3 
 
 		 637 aa  84  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  28.3 
 
 		 637 aa  83.6  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  28.12 
 
 		 671 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  33.88 
 
 		 670 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.44 
 
 		 664 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  27.12 
 
 		 334 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.55 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  26.8 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  26.95 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  26.8 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.4 
 
 		 665 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  26.49 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  25.51 
 
 		 696 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  28.46 
 
 		 653 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  25.07 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  26.73 
 
 		 660 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2350  magnesium chelatase, ChlI subunit  26.49 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.252625  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  26.69 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  26.5 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.3 
 
 		 668 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  27.04 
 
 		 669 aa  75.1  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  28.4 
 
 		 800 aa  75.1  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  24.46 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.77 
 
 		 678 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3462  magnesium chelatase ChlI subunit  25.16 
 
 		 754 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  23.18 
 
 		 738 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  26.67 
 
 		 690 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  26.56 
 
 		 680 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  25.33 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.4 
 
 		 701 aa  70.5  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  26.86 
 
 		 650 aa  70.5  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  25.51 
 
 		 713 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  24.18 
 
 		 594 aa  69.7  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.44 
 
 		 677 aa  69.7  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  25.36 
 
 		 705 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  32.11 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  25.9 
 
 		 683 aa  68.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  26.55 
 
 		 730 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>