125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0385 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0385  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  314  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 292 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3755  MerR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 294 aa  54.3  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 305 aa  52.4  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 255 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 247 aa  51.2  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 198 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 190 aa  50.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0291  hypothetical protein  38.36 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2536  regulatory protein MerR  32 
 
 		 111 aa  50.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0804  MerR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000127204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0743  MerR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 299 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  25.74 
 
 		 343 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4449  mercuric resistance operon regulatory protein  39.68 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00937003  normal  0.868186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0923  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0886  mercuric resistance operon regulatory protein  39.68 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1052  transcriptional regulator, putative  36.11 
 
 		 118 aa  48.5  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.019007 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  30.11 
 
 		 299 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 282 aa  47.8  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0444  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 208 aa  47.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 319 aa  47.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  38.75 
 
 		 269 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_002936  DET1412  HspR protein, putative  43.28 
 
 		 101 aa  47.4  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.18212  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.59 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  29.59 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1193  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0554847  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 298 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 321 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1219  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.100212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  29.59 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2379  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  29.59 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  29.59 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  29.59 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  29.59 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1615  MerR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1450  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.225656 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 273 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  32.46 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1606  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011829  hitchhiker  0.00000000000215836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 269 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  34.72 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2240  transcriptional regulator  32.23 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  36.67 
 
 		 255 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  36.14 
 
 		 271 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3872  transcriptional regulator, MerR family protein  41.67 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04765  putative transcriptional regulator protein  31.94 
 
 		 109 aa  45.1  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.397475  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0713  MerR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.245561  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5861  hypothetical protein  30.47 
 
 		 196 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  35.21 
 
 		 242 aa  44.3  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1810  transcriptional regulator, MerR family  27.87 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  normal  0.140149 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1817  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0592  transcriptional regulator, MerR family  31.65 
 
 		 196 aa  44.3  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000184153  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 138 aa  43.9  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 317 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3038  MerR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 125 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0025515  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0738  MerR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0876776  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1501  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.259398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2382  transcriptional regulator, MerR family  32.47 
 
 		 103 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  31.88 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 302 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  29.07 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10940  putative transcriptional regulator, MerR family  46.3 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.826856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3563  transcriptional regulator, MerR family  30.95 
 
 		 126 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  26.02 
 
 		 130 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1328  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000121427  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  27.64 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4827  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 133 aa  42  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 276 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4050  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1161  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 142 aa  42  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0215718 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1596  transcriptional regulator, MerR family  43.64 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.265626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1781  transcriptional regulator, MerR family  26.92 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0008  DNA-binding protein  28.08 
 
 		 202 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 129 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 98 aa  41.6  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  37.93 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>