29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3755 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3755  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  588  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0385  MerR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 162 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  35.29 
 
 		 183 aa  47.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10940  putative transcriptional regulator, MerR family  30.32 
 
 		 174 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.826856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0804  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 190 aa  45.8  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000127204  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 169 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 163 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1161  transcriptional regulator, MerR family  36.07 
 
 		 142 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0215718 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 141 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  37.68 
 
 		 141 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0592  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000184153  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 141 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 141 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 141 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 141 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 141 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 141 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 166 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 129 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 129 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 141 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3377  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 133 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 151 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  35.38 
 
 		 143 aa  42.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 129 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 124 aa  42.7  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>