179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_10940 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_10940  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 174 aa  343  8e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.826856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1619  transcriptional regulator MerR family  38.27 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550147  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  38.75 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  38.75 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1406  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0713  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.245561  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1366  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0483  transcriptional regulator, MerR family  35.56 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2588  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3377  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1445  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 112 aa  53.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.236755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1551  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 117 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4622  MerR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1772  MerR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 136 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328935  normal  0.318397 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2301  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 122 aa  51.2  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0887  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 112 aa  51.2  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0416797  hitchhiker  0.00000266118 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3295  transcriptional regulator, MerR family  29.75 
 
 		 231 aa  50.8  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987974  normal  0.206317 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0291  hypothetical protein  36.23 
 
 		 109 aa  50.8  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1633  hypothetical protein  35.14 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1640  transcriptional regulator, MerR family  28.3 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402978  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2633  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 123 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1148  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0650  transcriptional regulator, MerR family  33.75 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00809015 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0580  hypothetical protein  36.99 
 
 		 109 aa  50.1  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1522  transcriptional regulator, putative  31.07 
 
 		 117 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0919543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3038  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 125 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0025515  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4629  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00782953  normal  0.030329 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04765  putative transcriptional regulator protein  34.15 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.397475  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1457  transcriptional regulator, MerR family  27.38 
 
 		 118 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1521  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0401274  normal  0.779885 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28730  putative transcriptional regulator  30.49 
 
 		 118 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000134436  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0978  transcriptional regulator, MerR family  29.7 
 
 		 254 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2511  hypothetical protein  30.49 
 
 		 118 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  27.72 
 
 		 137 aa  48.5  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1459  MerR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 137 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1000  MerR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 137 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1482  MerR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 137 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.858746  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1983  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 118 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00884217  normal  0.359201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1892  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 110 aa  48.5  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2925  MerR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455933  hitchhiker  0.00151967 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1970  transcriptional regulator, MerR family  31.87 
 
 		 143 aa  47.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1588  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 195 aa  47.8  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1378  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 137 aa  47.8  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0815083  normal  0.541754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2536  regulatory protein MerR  36.05 
 
 		 111 aa  47.4  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  29 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2670  regulatory protein, MerR  32.14 
 
 		 125 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1889  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000504717  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7073  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323694  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1996  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000181748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1167  MerR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354578  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1199  transcriptional regulator, MerR family  25.44 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2749  transcriptional regulator, MerR family  32.88 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 130 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2847  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786709  hitchhiker  0.005225 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0640  MerR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1719  MerR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1288  transcriptional regulator, MerR family  30.1 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0772  hypothetical protein  32.94 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0831  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.087298  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4609  MerR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 136 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  normal  0.0601167 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1089  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1409  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1898  MerR family regulatory protein  32.88 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1938  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 118 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0494  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0739492  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 118 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1058  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3755  MerR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 294 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1532  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1008  transcriptional regulator, MerR family  35.06 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0196  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3031  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.532106 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1742  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0970  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 126 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  32.61 
 
 		 126 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  32.61 
 
 		 126 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2382  transcriptional regulator, MerR family  33.73 
 
 		 103 aa  45.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_002978  WD0058  hypothetical protein  38.03 
 
 		 108 aa  45.8  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1282  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2652  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 227 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00282985  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1881  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0804  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000127204  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2516  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1877  transcriptional regulator, MerR family  29.29 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  31.88 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0444  transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3966  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200799  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2678  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 252 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00961924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1259  transcriptional regulator, MerR family  29.85 
 
 		 121 aa  45.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0052  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2331  transcriptional regulator, MerR family  35.79 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00979491  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2393  MerR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  40.28 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0779  hypothetical protein  34.85 
 
 		 180 aa  45.1  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>