92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4175 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4175  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  100 
 
 		 160 aa  331  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00253481  normal  0.0237067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1494  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  37.09 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2678  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  34.44 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3236  putative dioxygenase beta subunit  36.54 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665811  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1344  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  35.33 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1503  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  37.97 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.223026  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5383  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  31.61 
 
 		 162 aa  87.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1875  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  34.57 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1994  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  33.33 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0637  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  33.76 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2669  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  36.94 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3813  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  31.08 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257439  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7072  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  33.33 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00762065  normal  0.538573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0827  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  31.82 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0728938  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1532  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  31.25 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.014275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0743  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  31.94 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2210  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  28.19 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4189  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.28 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2635  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  30.82 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2720  toluate 1,2-dioxygenase subunit beta  30.41 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32100  toluate 1,2-dioxygenase beta subunit  30.41 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2709  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  28.38 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.135302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2687  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  28.86 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2553  benzoate 1,2-dioxygenase  28.86 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2779  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  27.81 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3524  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  24.49 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0527056 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5080  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  24.49 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.218107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5354  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  24.49 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0204089  normal  0.785478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08600  benzoate-1,2-dioxygenase oxygenase component, beta subunit  28.76 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273819  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2322  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  28.86 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2967  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.76 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1266  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  29.27 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2157  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  24.48 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3162  benzoate dioxygenase, beta subunit  28.48 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.391126  normal  0.421073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1135  benzoate 1,2-dioxygenase  28.19 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5351  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  29.73 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.449745 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2497  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  23.81 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0182458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3863  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  27.03 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3902  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  23.81 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1681  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.45 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0889  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.1 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.93204  normal  0.763516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2104  putative aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  24.48 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0326  ring hydroxylating beta subunit  25.85 
 
 		 166 aa  51.2  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3618  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  23.13 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0914  benzoate 1,2-dioxygenase subunit beta BenB  27.52 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3193  putative aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  24.31 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4416  benzene 1,2-dioxygenase  29.6 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2369  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  26.85 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714007  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1354  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  28.38 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.160412  normal  0.158721 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0186  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  29.14 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.270999  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1359  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  29.14 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382783  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0214  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  29.14 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2582  benzoate 1,2 dioxygenase, beta subunit  29.14 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1555  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  29.14 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2726  benzoate 1,2 dioxygenase, beta subunit  29.14 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0472  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  29.61 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1178  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  29.03 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3896  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  24.16 
 
 		 169 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4159  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  29.05 
 
 		 181 aa  47.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4883  benzoate 1,2-dioxygenase subunit beta  26.45 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428911  normal  0.181589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2670  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  44.07 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4404  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  27.63 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1757  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.37 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5846  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  29.03 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5449  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  29.03 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1298  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  27.03 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1762  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  25.17 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070154 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7047  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  28.03 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6525  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  29.03 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3097  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  24.66 
 
 		 162 aa  44.3  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1827  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  27.45 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475727  normal  0.661206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3245  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  26.49 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000856848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4072  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  27.39 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161007  normal  0.827425 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1429  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  27.1 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0021557  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1325  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  32.97 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6132  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  28.39 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0631  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  26.24 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1000  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  30.39 
 
 		 697 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3555  p-cumate dioxygenase small subunit (CmtAc)  29.08 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0559586  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1372  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  30.77 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1674  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  26.24 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1390  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  30.77 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0521663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1699  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  26.24 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0534  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  26.24 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1406  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  27.21 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1648  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  26.24 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0549  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  26.24 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6583  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  28.39 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0528845  normal  0.624635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6298  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  28.39 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1365  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  26.39 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0217955  normal  0.119188 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42180  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  22.84 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242382  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5648  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  25.53 
 
 		 184 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>