88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1762 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1762  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  100 
 
 		 164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070154 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3863  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  54.27 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2111  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  50.32 
 
 		 162 aa  157  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0182348  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3097  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  51.32 
 
 		 162 aa  146  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2709  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  48.72 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.135302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2779  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  50.64 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2720  toluate 1,2-dioxygenase subunit beta  48.08 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230068  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2553  benzoate 1,2-dioxygenase  48.08 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2687  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  48.08 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32100  toluate 1,2-dioxygenase beta subunit  47.44 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3162  benzoate dioxygenase, beta subunit  47.44 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.391126  normal  0.421073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2369  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  48.08 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714007  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2322  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  48.08 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2967  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  48.39 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1266  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  45.81 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5351  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  44.52 
 
 		 167 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.449745 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0472  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  45.16 
 
 		 163 aa  141  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0914  benzoate 1,2-dioxygenase subunit beta BenB  44.23 
 
 		 163 aa  140  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4404  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  43.59 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1359  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  44.52 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382783  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0186  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  44.52 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.270999  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0214  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  44.52 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2635  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  46.45 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1555  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  44.52 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2582  benzoate 1,2 dioxygenase, beta subunit  44.52 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2726  benzoate 1,2 dioxygenase, beta subunit  44.52 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2724  anthranilate dioxygenase small subunit  43.23 
 
 		 163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32150  anthranilate dioxygenase small subunit  43.23 
 
 		 163 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.447185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1135  benzoate 1,2-dioxygenase  43.31 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1000  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  44.52 
 
 		 697 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1429  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  47.02 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0021557  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4883  benzoate 1,2-dioxygenase subunit beta  41.94 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428911  normal  0.181589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08600  benzoate-1,2-dioxygenase oxygenase component, beta subunit  46.79 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273819  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1178  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  44.38 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0539  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  46.05 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4159  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  42.95 
 
 		 181 aa  127  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1354  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  44.23 
 
 		 179 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.160412  normal  0.158721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1372  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  42.58 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7047  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  45.7 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1390  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  42.58 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0521663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1406  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  41.92 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1325  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  46.79 
 
 		 163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1298  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  42.68 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1365  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  47.02 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0217955  normal  0.119188 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6583  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  47.02 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0528845  normal  0.624635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1592  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  46.36 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.290973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6298  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  47.02 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502382 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6132  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  46.36 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1681  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  39.49 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6525  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  45.7 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3239  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  44.37 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144552 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1305  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  42.74 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1503  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  32.86 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.223026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3236  putative dioxygenase beta subunit  31.97 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665811  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0827  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.71 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0728938  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1994  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.38 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1875  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  33.12 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3245  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  31.61 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000856848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4175  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  25.17 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00253481  normal  0.0237067 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5383  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  26.62 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1344  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.99 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7072  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  31.47 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00762065  normal  0.538573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2669  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  31.21 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42180  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  26.67 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0637  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  26.28 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1494  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  28.1 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0436  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  29.53 
 
 		 167 aa  47.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00439897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4281  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  33.67 
 
 		 187 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119212  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2678  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  26.14 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2670  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  44 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3193  putative aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  27.74 
 
 		 217 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1532  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  27.7 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.014275 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5648  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  30.61 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3057  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  27.83 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219432 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0631  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  29.59 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1648  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  29.59 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0549  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  29.59 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1674  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  29.59 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1699  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  29.59 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0534  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  29.59 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1757  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  26.95 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2897  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.12 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.364758 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5449  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  29.59 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5846  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  29.59 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2708  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  31.46 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505083  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8365  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  30 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.203699  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0889  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.48 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.93204  normal  0.763516 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3860  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  25 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.705611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>