64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1305 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6525  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 162 aa  255  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1305  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 124 aa  254  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7047  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  91.94 
 
 		 162 aa  236  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1429  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  87.1 
 
 		 162 aa  227  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0021557  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6132  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  97.58 
 
 		 162 aa  224  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6583  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  94.35 
 
 		 162 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0528845  normal  0.624635 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3239  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  91.94 
 
 		 162 aa  216  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144552 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6298  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  93.55 
 
 		 162 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1365  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  87.1 
 
 		 162 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0217955  normal  0.119188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1178  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  79.03 
 
 		 162 aa  207  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1592  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  82.26 
 
 		 162 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.290973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0539  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  65.32 
 
 		 161 aa  178  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3162  benzoate dioxygenase, beta subunit  60.48 
 
 		 161 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.391126  normal  0.421073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2635  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  66.13 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2967  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  61.29 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2709  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  61.29 
 
 		 161 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.135302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2687  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  59.68 
 
 		 161 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2553  benzoate 1,2-dioxygenase  59.68 
 
 		 161 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2322  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  60.48 
 
 		 162 aa  169  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2111  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  62.1 
 
 		 162 aa  164  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0182348  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2779  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  58.87 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1135  benzoate 1,2-dioxygenase  57.6 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1298  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  60 
 
 		 182 aa  158  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2720  toluate 1,2-dioxygenase subunit beta  55.65 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32100  toluate 1,2-dioxygenase beta subunit  57.26 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08600  benzoate-1,2-dioxygenase oxygenase component, beta subunit  58.06 
 
 		 162 aa  157  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273819  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3097  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  58.87 
 
 		 162 aa  156  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1406  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  59.68 
 
 		 173 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1354  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  59.68 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.160412  normal  0.158721 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1390  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  59.68 
 
 		 173 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0521663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1372  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  59.68 
 
 		 173 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4159  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  58.87 
 
 		 181 aa  154  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2369  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  56.8 
 
 		 163 aa  152  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714007  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0914  benzoate 1,2-dioxygenase subunit beta BenB  54.84 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0186  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  53.23 
 
 		 163 aa  137  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.270999  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5351  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  53.23 
 
 		 167 aa  137  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.449745 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1359  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  53.23 
 
 		 163 aa  137  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382783  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0214  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  53.23 
 
 		 163 aa  137  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2582  benzoate 1,2 dioxygenase, beta subunit  53.23 
 
 		 163 aa  137  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1555  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  53.23 
 
 		 163 aa  137  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0472  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  54.84 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4404  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  51.61 
 
 		 163 aa  137  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2726  benzoate 1,2 dioxygenase, beta subunit  52.42 
 
 		 163 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1325  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  58.4 
 
 		 163 aa  135  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1000  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  53.23 
 
 		 697 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4883  benzoate 1,2-dioxygenase subunit beta  49.19 
 
 		 164 aa  130  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428911  normal  0.181589 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1266  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  48.39 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2724  anthranilate dioxygenase small subunit  45.97 
 
 		 163 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32150  anthranilate dioxygenase small subunit  45.97 
 
 		 163 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.447185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3863  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  43.55 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1681  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  46.03 
 
 		 166 aa  96.3  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1762  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  42.74 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1757  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  34.78 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2897  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  32.73 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.364758 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3555  p-cumate dioxygenase small subunit (CmtAc)  30.48 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0559586  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0827  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  35.71 
 
 		 196 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0728938  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3843  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  29.91 
 
 		 183 aa  41.6  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5383  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  35.11 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0889  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  32.98 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.93204  normal  0.763516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1690  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  31.13 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0766019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1717  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  31.13 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0547  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  31.13 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1661  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  31.13 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0144814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0536  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  31.13 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>