81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3863 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3863  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  100 
 
 		 165 aa  339  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1762  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  54.27 
 
 		 164 aa  171  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32100  toluate 1,2-dioxygenase beta subunit  50.65 
 
 		 162 aa  154  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2720  toluate 1,2-dioxygenase subunit beta  49.35 
 
 		 162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230068  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2111  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  46.45 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0182348  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2322  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  44.87 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2967  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  44.87 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2635  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  46.45 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2709  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  44.23 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.135302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2779  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  44.52 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1135  benzoate 1,2-dioxygenase  44.59 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3097  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  46.05 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2553  benzoate 1,2-dioxygenase  42.5 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0472  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  42.95 
 
 		 163 aa  137  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7047  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  43.67 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2687  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  42.5 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2369  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  45.51 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714007  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3162  benzoate dioxygenase, beta subunit  42.31 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.391126  normal  0.421073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4159  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  42.68 
 
 		 181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2724  anthranilate dioxygenase small subunit  41.29 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0186  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  41.94 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.270999  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0214  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  41.94 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2582  benzoate 1,2 dioxygenase, beta subunit  41.94 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1555  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  41.94 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1359  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  41.94 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2726  benzoate 1,2 dioxygenase, beta subunit  41.94 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32150  anthranilate dioxygenase small subunit  40.65 
 
 		 163 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.447185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1178  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  42.31 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1429  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  45.33 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0021557  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08600  benzoate-1,2-dioxygenase oxygenase component, beta subunit  42.95 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273819  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0914  benzoate 1,2-dioxygenase subunit beta BenB  42.31 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0539  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  42.48 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1354  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  42.04 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.160412  normal  0.158721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1298  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  42.68 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5351  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  41.29 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.449745 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1000  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  42.76 
 
 		 697 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4883  benzoate 1,2-dioxygenase subunit beta  39.35 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428911  normal  0.181589 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1266  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  39.35 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1406  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  40.38 
 
 		 173 aa  124  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1372  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  39.74 
 
 		 173 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1325  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  46.2 
 
 		 163 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1390  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  39.74 
 
 		 173 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0521663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6583  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  46.31 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0528845  normal  0.624635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6298  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  46.31 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502382 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4404  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  39.1 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1365  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  43.11 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0217955  normal  0.119188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1592  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  40.38 
 
 		 162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.290973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6525  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  45.64 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6132  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  44.97 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3239  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  43.33 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144552 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1681  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  37.01 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1305  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  43.55 
 
 		 124 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3236  putative dioxygenase beta subunit  29.45 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665811  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1503  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  31.21 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.223026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3193  putative aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.66 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4175  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  27.03 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00253481  normal  0.0237067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0827  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.37 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0728938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3245  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  27.81 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000856848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1344  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.66 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2669  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  33.33 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1827  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  31.43 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475727  normal  0.661206 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5383  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  24.52 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42180  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  29.73 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242382  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1875  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  26.99 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2210  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  33.33 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1532  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  32.61 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.014275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1494  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  24.65 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2678  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.47 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3813  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  36.05 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0743  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.08 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0984  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.58 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147739  hitchhiker  0.000202468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2897  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.47 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.364758 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0166  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.99 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000302415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4281  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.71 
 
 		 187 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119212  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0536  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.23 
 
 		 172 aa  40.8  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0326  ring hydroxylating beta subunit  30 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0547  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.23 
 
 		 172 aa  40.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948584 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1717  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.23 
 
 		 172 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2670  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  24.67 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.445866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1661  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.23 
 
 		 172 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0144814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1690  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.23 
 
 		 172 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0766019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>