79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3193 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3193  putative aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  100 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0827  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  38.14 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0728938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1503  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  34.25 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.223026  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2897  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  31.06 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.364758 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3555  p-cumate dioxygenase small subunit (CmtAc)  32.92 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0559586  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1494  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  31.17 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2669  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  33.56 
 
 		 154 aa  62  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1266  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  29.41 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2678  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  31.33 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2635  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  31.72 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3236  putative dioxygenase beta subunit  31.47 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665811  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1178  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  29.25 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1555  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  33.33 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1359  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  33.33 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382783  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2582  benzoate 1,2 dioxygenase, beta subunit  33.33 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0214  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  33.33 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0186  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  33.33 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.270999  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2779  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.7 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0743  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2726  benzoate 1,2 dioxygenase, beta subunit  33.33 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1681  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  27.5 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3863  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.66 
 
 		 165 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0889  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  27.1 
 
 		 176 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.93204  normal  0.763516 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7047  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  31.25 
 
 		 162 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0472  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  28.23 
 
 		 163 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3097  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  28.57 
 
 		 162 aa  52.8  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1429  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  28.48 
 
 		 162 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0021557  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1000  benzoate 1,2-dioxygenase beta subunit  33.33 
 
 		 697 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0539  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  34.48 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1875  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2720  toluate 1,2-dioxygenase subunit beta  28.89 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230068  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0914  benzoate 1,2-dioxygenase subunit beta BenB  29.41 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5351  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  30.17 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.449745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1406  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  31.31 
 
 		 173 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4072  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.09 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161007  normal  0.827425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1592  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  27.59 
 
 		 162 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.290973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7072  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  26.75 
 
 		 177 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00762065  normal  0.538573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4175  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  24.31 
 
 		 160 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00253481  normal  0.0237067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2369  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  30.43 
 
 		 163 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714007  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1354  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  35.71 
 
 		 179 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.160412  normal  0.158721 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1196  biphenyl 2,3-dioxygenase small subunit (BphA2)  29.68 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.45736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1827  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  27.95 
 
 		 160 aa  48.5  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475727  normal  0.661206 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5383  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  26 
 
 		 162 aa  48.5  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6583  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  28.67 
 
 		 162 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0528845  normal  0.624635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6298  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  28.67 
 
 		 162 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4281  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  22.22 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119212  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1135  benzoate 1,2-dioxygenase  26.57 
 
 		 163 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3813  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  26.75 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257439  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2322  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  28.26 
 
 		 162 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1372  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  30.3 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4159  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  33.33 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1390  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  30.3 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0521663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2967  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.26 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2880  toluene dioxygenase  23.98 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4347  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  26.83 
 
 		 179 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.285942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1325  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  32.08 
 
 		 163 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2687  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  27.17 
 
 		 161 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08600  benzoate-1,2-dioxygenase oxygenase component, beta subunit  28.93 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273819  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1298  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  32.14 
 
 		 182 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32100  toluate 1,2-dioxygenase beta subunit  27.01 
 
 		 162 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2553  benzoate 1,2-dioxygenase  27.17 
 
 		 161 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2709  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  28.26 
 
 		 161 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.135302 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4151  benzene 1,2-dioxygenase  25.56 
 
 		 188 aa  45.4  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0735221  normal  0.34405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2111  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  25.87 
 
 		 162 aa  45.1  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0182348  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2670  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  38.89 
 
 		 119 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3162  benzoate dioxygenase, beta subunit  27 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.391126  normal  0.421073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2724  anthranilate dioxygenase small subunit  27.21 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6525  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  27.97 
 
 		 162 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1532  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  27.52 
 
 		 162 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.014275 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4883  benzoate 1,2-dioxygenase subunit beta  27.59 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428911  normal  0.181589 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2157  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  25.81 
 
 		 166 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6132  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  27.27 
 
 		 162 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3239  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  27.97 
 
 		 162 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4404  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  27.42 
 
 		 163 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3841  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  26.77 
 
 		 175 aa  42.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5846  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  28.45 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5449  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  28.45 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37550  putative ring-hydroxylating dioxygenase small subunit  28.99 
 
 		 169 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0448308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1365  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  28.48 
 
 		 162 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0217955  normal  0.119188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>