89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0743 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0743  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  100 
 
 		 171 aa  347  6e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3813  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  70.51 
 
 		 165 aa  217  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257439  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3896  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  44.81 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2210  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  43.51 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3524  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  44.37 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0527056 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5080  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  44.37 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.218107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5354  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  43.71 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0204089  normal  0.785478 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3618  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  43.05 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3902  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  43.05 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2497  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  42.38 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0182458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0326  ring hydroxylating beta subunit  40.91 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2104  putative aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  38.04 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1827  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  40.52 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475727  normal  0.661206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2157  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  36.81 
 
 		 166 aa  121  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4189  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  38.71 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692425 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5383  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  30.07 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0637  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  31.08 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1994  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  32.21 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7072  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  31.08 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00762065  normal  0.538573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4175  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  31.94 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00253481  normal  0.0237067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1875  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  31.51 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1494  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  29.41 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1344  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.07 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1532  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.46 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.014275 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2678  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.03 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4072  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.57 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161007  normal  0.827425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4416  benzene 1,2-dioxygenase  35.79 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1266  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  28.31 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3193  putative aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0889  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.51 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.93204  normal  0.763516 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2880  toluene dioxygenase  29.38 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3236  putative dioxygenase beta subunit  24.82 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665811  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1757  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.03 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2635  2-chlorobenzoate 1,2-dioxygenase  26.14 
 
 		 171 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1503  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  27.63 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.223026  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1681  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  26.99 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0827  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  24.83 
 
 		 196 aa  51.2  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0728938  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4151  benzene 1,2-dioxygenase  26.75 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0735221  normal  0.34405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0663  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0487  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1634  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.22 
 
 		 236 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1667  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.22 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.595327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1660  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.22 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5621  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.22 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0675281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1641  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  30.22 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2238  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.29 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5625  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.29 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5846  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  27.41 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5449  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  27.41 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3555  p-cumate dioxygenase small subunit (CmtAc)  31.93 
 
 		 180 aa  47.8  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0559586  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5648  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  31.45 
 
 		 184 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2369  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  25.32 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714007  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2897  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.67 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.364758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0670  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.5 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0572  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.5 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.455615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0568  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.08 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.924793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2244  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.5 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0227902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1607  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.5 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1196  biphenyl 2,3-dioxygenase small subunit (BphA2)  27.5 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.45736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0483  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  29.5 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5839  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  27.89 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5442  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  27.89 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0631  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  30.65 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0549  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  30.65 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1648  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  30.65 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0534  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  30.65 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1699  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  30.65 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1674  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  30.65 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5611  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  27.89 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02395  hypothetical protein  30.23 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1138  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  30.23 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1129  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  30.23 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2692  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  30.23 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.206867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2824  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  30.23 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2691  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  30.23 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1135  benzoate 1,2-dioxygenase  25.16 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0625  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.45 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0543  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.45 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1654  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.45 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0540  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.45 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1710  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.45 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.610525  normal  0.664469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1681  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.45 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02431  3-phenylpropionate dioxygenase, small (beta) subunit  30.23 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4281  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  27.59 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119212  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3863  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.08 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37550  putative ring-hydroxylating dioxygenase small subunit  23.26 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0448308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2684  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase subunit beta  31.76 
 
 		 170 aa  42  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0747895 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2779  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  24.67 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5351  benzoate 1,2-dioxygenase, small subunit  25 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.449745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>