39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25270 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25270  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  255  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1001  hypothetical protein  50.41 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3125  hypothetical protein  43.65 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2687  amino acid-binding ACT domain protein  41.59 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2883  hypothetical protein  49.57 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0829751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2742  hypothetical protein  41.73 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1266  hypothetical protein  41.73 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2413  hypothetical protein  37.8 
 
 		 128 aa  94  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.753128  hitchhiker  0.00000411469 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1867  hypothetical protein  37.8 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167229 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2508  hypothetical protein  40.16 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2193  hypothetical protein  42.62 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2015  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.13 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1996  hypothetical protein  32.28 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2239  hypothetical protein  34.4 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2348  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.07 
 
 		 131 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0598087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2464  amino acid-binding ACT domain protein  33.07 
 
 		 131 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00361411  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2359  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.07 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46182  predicted protein  40.74 
 
 		 379 aa  84  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1999  hypothetical protein  32.28 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000289141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4520  hypothetical protein  45.24 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2255  hypothetical protein  36 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1844  hypothetical protein  34.4 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1766  hypothetical protein  34.4 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.645552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3142  hypothetical protein  55.91 
 
 		 149 aa  80.1  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30971  normal  0.0874691 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1652  hypothetical protein  35.16 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1511  hypothetical protein  31.09 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2117  hypothetical protein  32 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5030  hypothetical protein  42.06 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0107  hypothetical protein  39.83 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1913  hypothetical protein  37.78 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0710  hypothetical protein  30.33 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2975  conserved hypothetical protein-like protein  31.75 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26520  hypothetical protein  38.71 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0892158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0890  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.83 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0186832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0227  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.59 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7650  hypothetical protein  40.5 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0312  hypothetical protein  41.07 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.784032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4484  hypothetical protein  31.2 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1115  hypothetical protein  29.69 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.410877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>