13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0227 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0227  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  288  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0890  amino acid-binding ACT domain-containing protein  87.07 
 
 		 148 aa  255  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0186832 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2975  conserved hypothetical protein-like protein  35.8 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1001  hypothetical protein  34.12 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3125  hypothetical protein  38.1 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2664  hypothetical protein  37.29 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1683  hypothetical protein  36.51 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.727373 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1749  hypothetical protein  40.91 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2155  hypothetical protein  30.61 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1867  hypothetical protein  26.12 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167229 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2687  amino acid-binding ACT domain protein  32.84 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4678  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0877  hypothetical protein  30.3 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>