37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3125 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3125  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1001  hypothetical protein  54.17 
 
 
129 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0107  hypothetical protein  53.23 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2883  hypothetical protein  49.61 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0829751  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2015  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45 
 
 
128 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2742  hypothetical protein  52.68 
 
 
126 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2687  amino acid-binding ACT domain protein  44.63 
 
 
130 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25270  hypothetical protein  43.65 
 
 
130 aa  100  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37988  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46182  predicted protein  48.15 
 
 
379 aa  100  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4520  hypothetical protein  43.55 
 
 
134 aa  99.4  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1867  hypothetical protein  41.32 
 
 
130 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2413  hypothetical protein  39.34 
 
 
128 aa  97.8  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.753128  hitchhiker  0.00000411469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2239  hypothetical protein  38.52 
 
 
128 aa  97.1  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1996  hypothetical protein  40.71 
 
 
128 aa  97.1  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1511  hypothetical protein  38.21 
 
 
123 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0710  hypothetical protein  36.72 
 
 
136 aa  94  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1766  hypothetical protein  36.22 
 
 
131 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.645552  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1844  hypothetical protein  36.22 
 
 
131 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2348  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.71 
 
 
131 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0598087  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3142  hypothetical protein  45.45 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30971  normal  0.0874691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2255  hypothetical protein  38.66 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.289641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2464  amino acid-binding ACT domain protein  35.71 
 
 
131 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00361411  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2359  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.71 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1652  hypothetical protein  38.02 
 
 
132 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1999  hypothetical protein  35.71 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000289141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2193  hypothetical protein  40.16 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2508  hypothetical protein  36.29 
 
 
127 aa  90.9  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2117  hypothetical protein  34.38 
 
 
131 aa  89.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1266  hypothetical protein  38.4 
 
 
125 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5030  hypothetical protein  40 
 
 
127 aa  87  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1913  hypothetical protein  41.94 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26520  hypothetical protein  31.4 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0892158  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2975  conserved hypothetical protein-like protein  34.71 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0312  hypothetical protein  34.92 
 
 
135 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.784032  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0227  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.1 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7650  hypothetical protein  39.06 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0890  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.82 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0186832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>