35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3142 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3142  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  285  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30971  normal  0.0874691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1001  hypothetical protein  54.33 
 
 
129 aa  140  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321285 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2883  hypothetical protein  52.24 
 
 
134 aa  124  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0829751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2687  amino acid-binding ACT domain protein  49.18 
 
 
130 aa  123  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3125  hypothetical protein  45.45 
 
 
134 aa  120  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2742  hypothetical protein  50.82 
 
 
126 aa  120  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2015  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.89 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0107  hypothetical protein  42.31 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46182  predicted protein  39.53 
 
 
379 aa  94  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2239  hypothetical protein  36.89 
 
 
128 aa  89.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25270  hypothetical protein  50 
 
 
130 aa  89.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37988  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2508  hypothetical protein  39.13 
 
 
127 aa  85.5  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1266  hypothetical protein  43.2 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1766  hypothetical protein  36.89 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.645552  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1844  hypothetical protein  36.89 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2255  hypothetical protein  42.31 
 
 
131 aa  84  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.289641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1996  hypothetical protein  38.24 
 
 
128 aa  84  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1867  hypothetical protein  41.94 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4520  hypothetical protein  42.52 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2117  hypothetical protein  35.25 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1652  hypothetical protein  40.2 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2348  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.07 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0598087  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2413  hypothetical protein  37.89 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.753128  hitchhiker  0.00000411469 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2464  amino acid-binding ACT domain protein  33.07 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00361411  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2359  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.07 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1999  hypothetical protein  32.28 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000289141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2193  hypothetical protein  35.48 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1913  hypothetical protein  41.94 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1511  hypothetical protein  29.84 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5030  hypothetical protein  40.16 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0710  hypothetical protein  26.47 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2975  conserved hypothetical protein-like protein  34.96 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26520  hypothetical protein  38.36 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0892158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0312  hypothetical protein  34.88 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.784032  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08181  conserved hypothetical protein  29.6 
 
 
475 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.443927  normal  0.383204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>