34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0107 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0107  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  262  8.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3125  hypothetical protein  53.23 
 
 
134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2742  hypothetical protein  45.53 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2883  hypothetical protein  45.61 
 
 
134 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0829751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1001  hypothetical protein  40.31 
 
 
129 aa  104  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321285 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2687  amino acid-binding ACT domain protein  41.07 
 
 
130 aa  100  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2015  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.13 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46182  predicted protein  40.38 
 
 
379 aa  88.6  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3142  hypothetical protein  42.62 
 
 
149 aa  84.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30971  normal  0.0874691 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25270  hypothetical protein  39.83 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37988  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1266  hypothetical protein  34.92 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1867  hypothetical protein  36.21 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4520  hypothetical protein  37.1 
 
 
134 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2464  amino acid-binding ACT domain protein  29.03 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00361411  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2348  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.03 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0598087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2359  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.03 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1999  hypothetical protein  28.23 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000289141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1766  hypothetical protein  28.23 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.645552  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1844  hypothetical protein  28.23 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2255  hypothetical protein  29.03 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.289641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1652  hypothetical protein  29.84 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2508  hypothetical protein  29.84 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2239  hypothetical protein  25.81 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1996  hypothetical protein  31.78 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2413  hypothetical protein  28.57 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.753128  hitchhiker  0.00000411469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5030  hypothetical protein  36.79 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2193  hypothetical protein  33.02 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1511  hypothetical protein  32.29 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2117  hypothetical protein  25.81 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0710  hypothetical protein  25.66 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26520  hypothetical protein  25.38 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0892158  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1913  hypothetical protein  32.05 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2975  conserved hypothetical protein-like protein  32 
 
 
127 aa  42  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0312  hypothetical protein  32.48 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.784032  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>