33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1652 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1652  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  271  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1766  hypothetical protein  69.23 
 
 		 131 aa  188  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.645552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1844  hypothetical protein  69.23 
 
 		 131 aa  188  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1867  hypothetical protein  71.43 
 
 		 130 aa  188  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2413  hypothetical protein  68.25 
 
 		 128 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.753128  hitchhiker  0.00000411469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2255  hypothetical protein  69.84 
 
 		 131 aa  184  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2359  amino acid-binding ACT domain-containing protein  68.25 
 
 		 131 aa  183  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2464  amino acid-binding ACT domain protein  67.46 
 
 		 131 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00361411  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2348  amino acid-binding ACT domain-containing protein  67.46 
 
 		 131 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0598087  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1999  hypothetical protein  67.46 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000289141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1996  hypothetical protein  66.67 
 
 		 128 aa  176  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2239  hypothetical protein  65.87 
 
 		 128 aa  174  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2117  hypothetical protein  60 
 
 		 131 aa  173  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2193  hypothetical protein  69.05 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2508  hypothetical protein  44.72 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3125  hypothetical protein  38.02 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1001  hypothetical protein  40.65 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321285 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2883  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0829751  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46182  predicted protein  44.34 
 
 		 379 aa  90.1  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1511  hypothetical protein  42.31 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1913  hypothetical protein  45.05 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2742  hypothetical protein  34.15 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2687  amino acid-binding ACT domain protein  37.1 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0710  hypothetical protein  37.01 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1266  hypothetical protein  39.45 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307695  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25270  hypothetical protein  35.2 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2015  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.09 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3142  hypothetical protein  40.62 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30971  normal  0.0874691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4520  hypothetical protein  31.31 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0107  hypothetical protein  31.78 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26520  hypothetical protein  38.67 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0892158  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5030  hypothetical protein  29.79 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2975  conserved hypothetical protein-like protein  33.33 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>