33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1996 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1996  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  261  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1867  hypothetical protein  73.44 
 
 		 130 aa  200  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2413  hypothetical protein  71.88 
 
 		 128 aa  197  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.753128  hitchhiker  0.00000411469 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1999  hypothetical protein  66.4 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000289141 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2464  amino acid-binding ACT domain protein  66.4 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00361411  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2359  amino acid-binding ACT domain-containing protein  66.4 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2348  amino acid-binding ACT domain-containing protein  66.4 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0598087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2193  hypothetical protein  69.53 
 
 		 128 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1652  hypothetical protein  66.67 
 
 		 132 aa  176  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1766  hypothetical protein  64.8 
 
 		 131 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.645552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1844  hypothetical protein  64.8 
 
 		 131 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2255  hypothetical protein  64 
 
 		 131 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2239  hypothetical protein  60.8 
 
 		 128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2117  hypothetical protein  60.8 
 
 		 131 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2508  hypothetical protein  45.6 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3125  hypothetical protein  40.71 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46182  predicted protein  40.98 
 
 		 379 aa  96.3  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1001  hypothetical protein  39.52 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321285 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2742  hypothetical protein  36.8 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1913  hypothetical protein  39.67 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2883  hypothetical protein  39 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0829751  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1266  hypothetical protein  39.84 
 
 		 125 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307695  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0710  hypothetical protein  34.4 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2687  amino acid-binding ACT domain protein  35.2 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1511  hypothetical protein  40.82 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25270  hypothetical protein  32.28 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3142  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30971  normal  0.0874691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2015  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.09 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0107  hypothetical protein  31.78 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5030  hypothetical protein  27.78 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4520  hypothetical protein  26.98 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26520  hypothetical protein  39.19 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0892158  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2975  conserved hypothetical protein-like protein  36.36 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>