34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1999 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1999  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000289141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2359  amino acid-binding ACT domain-containing protein  99.24 
 
 
131 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2464  amino acid-binding ACT domain protein  98.47 
 
 
131 aa  269  9e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00361411  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2348  amino acid-binding ACT domain-containing protein  98.47 
 
 
131 aa  269  9e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0598087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1766  hypothetical protein  81.4 
 
 
131 aa  221  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.645552  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1844  hypothetical protein  81.4 
 
 
131 aa  221  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2255  hypothetical protein  80.62 
 
 
131 aa  221  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.289641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2117  hypothetical protein  76.74 
 
 
131 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2239  hypothetical protein  71.88 
 
 
128 aa  196  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1652  hypothetical protein  67.46 
 
 
132 aa  181  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1996  hypothetical protein  66.4 
 
 
128 aa  181  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2413  hypothetical protein  65.6 
 
 
128 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.753128  hitchhiker  0.00000411469 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1867  hypothetical protein  67.74 
 
 
130 aa  178  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2193  hypothetical protein  62.4 
 
 
128 aa  154  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2508  hypothetical protein  43.2 
 
 
127 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1001  hypothetical protein  39.84 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3125  hypothetical protein  35.71 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46182  predicted protein  38.89 
 
 
379 aa  91.7  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1511  hypothetical protein  43.88 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1266  hypothetical protein  39.84 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2883  hypothetical protein  34.96 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0829751  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0710  hypothetical protein  32.56 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1913  hypothetical protein  36.8 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2687  amino acid-binding ACT domain protein  37.9 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2742  hypothetical protein  30.08 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25270  hypothetical protein  32.28 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37988  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2015  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.7 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0107  hypothetical protein  30.84 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26520  hypothetical protein  42.05 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0892158  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4520  hypothetical protein  26.19 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3142  hypothetical protein  36 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30971  normal  0.0874691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5030  hypothetical protein  25.4 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2975  conserved hypothetical protein-like protein  33.33 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0312  hypothetical protein  29.46 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.784032  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>