24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0312 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0312  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  270  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.784032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7650  hypothetical protein  58.12 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3125  hypothetical protein  34.92 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2015  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.83 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1266  hypothetical protein  39.47 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1001  hypothetical protein  32.99 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2239  hypothetical protein  29.29 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1511  hypothetical protein  25 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2255  hypothetical protein  34.83 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1844  hypothetical protein  29.91 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1766  hypothetical protein  29.91 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.645552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4520  hypothetical protein  44.07 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2742  hypothetical protein  29.27 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26520  hypothetical protein  26.05 
 
 		 128 aa  42.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0892158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1867  hypothetical protein  35.85 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167229 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2359  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.46 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1999  hypothetical protein  29.46 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000289141 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08181  conserved hypothetical protein  42.22 
 
 		 475 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.443927  normal  0.383204 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2348  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.46 
 
 		 131 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0598087  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2413  hypothetical protein  35.29 
 
 		 128 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.753128  hitchhiker  0.00000411469 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2464  amino acid-binding ACT domain protein  29.46 
 
 		 131 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00361411  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2975  conserved hypothetical protein-like protein  34.67 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2687  amino acid-binding ACT domain protein  33.9 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3142  hypothetical protein  35.09 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30971  normal  0.0874691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>