34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2015 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2015  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 		 128 aa  263  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3125  hypothetical protein  45 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1001  hypothetical protein  38.21 
 
 		 129 aa  103  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0107  hypothetical protein  43.75 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2883  hypothetical protein  43.64 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0829751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2687  amino acid-binding ACT domain protein  32.81 
 
 		 130 aa  91.3  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2742  hypothetical protein  33.87 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4520  hypothetical protein  37.3 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25270  hypothetical protein  34.13 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1867  hypothetical protein  36.27 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167229 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1511  hypothetical protein  30.33 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2193  hypothetical protein  35.09 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5030  hypothetical protein  34.13 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3142  hypothetical protein  36.89 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30971  normal  0.0874691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2359  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.7 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1999  hypothetical protein  30.7 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000289141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2348  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.7 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0598087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2464  amino acid-binding ACT domain protein  30.7 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00361411  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1996  hypothetical protein  30.09 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2239  hypothetical protein  29.82 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2413  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.753128  hitchhiker  0.00000411469 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1266  hypothetical protein  31.75 
 
 		 125 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1652  hypothetical protein  30.09 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1913  hypothetical protein  30.34 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1844  hypothetical protein  28.95 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1766  hypothetical protein  28.95 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.645552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2255  hypothetical protein  29.82 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289641 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46182  predicted protein  29.73 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2117  hypothetical protein  28.95 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26520  hypothetical protein  30.38 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0892158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2508  hypothetical protein  30.47 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0312  hypothetical protein  30.83 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.784032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2975  conserved hypothetical protein-like protein  29.27 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0710  hypothetical protein  19.67 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>