33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2508 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2508  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  259  6e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1867  hypothetical protein  47.2 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2413  hypothetical protein  45.67 
 
 		 128 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.753128  hitchhiker  0.00000411469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1766  hypothetical protein  45.6 
 
 		 131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.645552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1844  hypothetical protein  45.6 
 
 		 131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2239  hypothetical protein  44 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2255  hypothetical protein  44.8 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2464  amino acid-binding ACT domain protein  43.2 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00361411  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2359  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.2 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1999  hypothetical protein  43.2 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000289141 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2117  hypothetical protein  43.2 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1996  hypothetical protein  45.6 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2348  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.2 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0598087  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1652  hypothetical protein  44.72 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2193  hypothetical protein  45.67 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2742  hypothetical protein  38.4 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3125  hypothetical protein  36.29 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2687  amino acid-binding ACT domain protein  39.29 
 
 		 130 aa  90.5  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1001  hypothetical protein  37.84 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321285 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1913  hypothetical protein  42.11 
 
 		 123 aa  87  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2883  hypothetical protein  35.83 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0829751  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25270  hypothetical protein  40.16 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1266  hypothetical protein  39.67 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307695  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46182  predicted protein  38.89 
 
 		 379 aa  77.8  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0710  hypothetical protein  29.77 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1511  hypothetical protein  34.69 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3142  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30971  normal  0.0874691 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0107  hypothetical protein  29.36 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2975  conserved hypothetical protein-like protein  31.01 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2015  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.47 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4520  hypothetical protein  31.2 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26520  hypothetical protein  27.13 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0892158  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5030  hypothetical protein  31.36 
 
 		 127 aa  52.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0496601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>