38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26520 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_26520  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  254  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0892158  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3125  hypothetical protein  31.4 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2117  hypothetical protein  41.38 
 
 
131 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2348  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.91 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0598087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2464  amino acid-binding ACT domain protein  40.91 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00361411  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1511  hypothetical protein  29.75 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1999  hypothetical protein  42.05 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000289141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2359  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.05 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1867  hypothetical protein  43.06 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2742  hypothetical protein  29.6 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1766  hypothetical protein  40.96 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.645552  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1844  hypothetical protein  40.96 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2687  amino acid-binding ACT domain protein  33.33 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2255  hypothetical protein  39.76 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.289641 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1266  hypothetical protein  30.65 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1001  hypothetical protein  41.89 
 
 
129 aa  62.8  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2413  hypothetical protein  43.24 
 
 
128 aa  62  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.753128  hitchhiker  0.00000411469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2239  hypothetical protein  36.84 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2015  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.38 
 
 
128 aa  60.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46182  predicted protein  35.92 
 
 
379 aa  59.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2193  hypothetical protein  38.81 
 
 
128 aa  57.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2883  hypothetical protein  32 
 
 
134 aa  57.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0829751  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1996  hypothetical protein  39.19 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1913  hypothetical protein  35 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1652  hypothetical protein  38.67 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2508  hypothetical protein  27.13 
 
 
127 aa  53.9  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2155  hypothetical protein  32.17 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0107  hypothetical protein  25 
 
 
131 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0710  hypothetical protein  35.94 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2975  conserved hypothetical protein-like protein  29.2 
 
 
127 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4678  hypothetical protein  47.17 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3028  hypothetical protein  35.16 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.398731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0312  hypothetical protein  26.05 
 
 
135 aa  42.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.784032  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2800  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3142  hypothetical protein  38.89 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30971  normal  0.0874691 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25270  hypothetical protein  38.71 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37988  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4484  hypothetical protein  32.76 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4520  hypothetical protein  32.84 
 
 
134 aa  40.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>