33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3028 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3028  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  270  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4484  hypothetical protein  60.15 
 
 		 133 aa  174  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2800  hypothetical protein  61.24 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4935  hypothetical protein  58.46 
 
 		 133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56750  hypothetical protein  58.91 
 
 		 133 aa  150  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4867  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0329  hypothetical protein  53.79 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1115  hypothetical protein  51.11 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1226  GCN5-related N-acetyltransferase  53.33 
 
 		 314 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000639538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  47.33 
 
 		 331 aa  126  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4678  hypothetical protein  47.69 
 
 		 135 aa  126  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1603  hypothetical protein  48.89 
 
 		 133 aa  119  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000462235  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1959  hypothetical protein  54.26 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6119  hypothetical protein  54.26 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1874  hypothetical protein  54.33 
 
 		 136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.636885  normal  0.0948364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0877  hypothetical protein  44.96 
 
 		 141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1983  hypothetical protein  52.99 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1683  hypothetical protein  42.96 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.727373 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1947  hypothetical protein  52.71 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3135  hypothetical protein  50.77 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5270  hypothetical protein  53.54 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0767  transporter  46.92 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0100171  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1913  hypothetical protein  45.11 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.307304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2155  hypothetical protein  44.19 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6513  hypothetical protein  42.62 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00684  hypothetical protein  42.86 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1461  hypothetical protein  42.86 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1749  hypothetical protein  42.28 
 
 		 136 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  49.18 
 
 		 292 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2664  hypothetical protein  37.3 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1423  hypothetical protein  39.32 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.969669  hitchhiker  0.000000364034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2290  Protein of unknown function DUF2241  42.64 
 
 		 134 aa  76.6  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.257133  normal  0.718354 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26520  hypothetical protein  35.16 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0892158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>