32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00684 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00684  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  270  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1603  hypothetical protein  47.33 
 
 
133 aa  117  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000462235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2800  hypothetical protein  47.33 
 
 
132 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4484  hypothetical protein  46.56 
 
 
133 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1461  hypothetical protein  46.56 
 
 
132 aa  103  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  41.22 
 
 
331 aa  103  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0767  transporter  46.56 
 
 
131 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0100171  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3028  hypothetical protein  42.86 
 
 
135 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.398731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4867  hypothetical protein  43.18 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1115  hypothetical protein  43.51 
 
 
137 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1913  hypothetical protein  42.52 
 
 
131 aa  99  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.307304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0329  hypothetical protein  43.65 
 
 
132 aa  97.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1226  GCN5-related N-acetyltransferase  41.22 
 
 
314 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000639538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3135  hypothetical protein  42.97 
 
 
131 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4935  hypothetical protein  43.18 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2155  hypothetical protein  40.46 
 
 
133 aa  90.9  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4678  hypothetical protein  40.91 
 
 
135 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1423  hypothetical protein  44.92 
 
 
138 aa  87.8  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.969669  hitchhiker  0.000000364034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6513  hypothetical protein  42.06 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0877  hypothetical protein  38.17 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1874  hypothetical protein  44.27 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.636885  normal  0.0948364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  40 
 
 
292 aa  84.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56750  hypothetical protein  45.04 
 
 
133 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1947  hypothetical protein  43.51 
 
 
158 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1749  hypothetical protein  39.53 
 
 
136 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153777  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1983  hypothetical protein  42.75 
 
 
136 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6119  hypothetical protein  43.85 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1959  hypothetical protein  43.85 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5270  hypothetical protein  40.46 
 
 
136 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2664  hypothetical protein  38.1 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618681  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1683  hypothetical protein  35.88 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.727373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2290  Protein of unknown function DUF2241  34.51 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.257133  normal  0.718354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>