34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2664 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2664  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  291  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618681  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1749  hypothetical protein  75.74 
 
 
136 aa  210  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153777  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6513  hypothetical protein  62.9 
 
 
132 aa  163  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0877  hypothetical protein  59.06 
 
 
141 aa  148  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1683  hypothetical protein  52.46 
 
 
135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.727373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4678  hypothetical protein  42.75 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4484  hypothetical protein  43.09 
 
 
133 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4935  hypothetical protein  45.97 
 
 
133 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2155  hypothetical protein  40.94 
 
 
133 aa  103  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  45.16 
 
 
331 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3135  hypothetical protein  45.97 
 
 
131 aa  100  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56750  hypothetical protein  45.97 
 
 
133 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  45.53 
 
 
292 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0329  hypothetical protein  42.06 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1115  hypothetical protein  38.89 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2800  hypothetical protein  39.5 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3028  hypothetical protein  37.3 
 
 
135 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.398731 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1913  hypothetical protein  41.32 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.307304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1461  hypothetical protein  41.32 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1226  GCN5-related N-acetyltransferase  40.77 
 
 
314 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000639538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1603  hypothetical protein  40.94 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000462235  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1423  hypothetical protein  42.61 
 
 
138 aa  84  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.969669  hitchhiker  0.000000364034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0767  transporter  41.8 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0100171  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1874  hypothetical protein  39.68 
 
 
136 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.636885  normal  0.0948364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1947  hypothetical protein  39.68 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4867  hypothetical protein  33.07 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1959  hypothetical protein  39.68 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6119  hypothetical protein  39.68 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1983  hypothetical protein  38.89 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5270  hypothetical protein  39.68 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00684  hypothetical protein  38.1 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2290  Protein of unknown function DUF2241  34.15 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.257133  normal  0.718354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0890  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.29 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0186832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0227  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.29 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>