33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6513 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6513  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  265  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1749  hypothetical protein  64.57 
 
 
136 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153777  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2664  hypothetical protein  62.9 
 
 
143 aa  163  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618681  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0877  hypothetical protein  52.38 
 
 
141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1683  hypothetical protein  50 
 
 
135 aa  133  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.727373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4484  hypothetical protein  48.44 
 
 
133 aa  123  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4678  hypothetical protein  45.53 
 
 
135 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4935  hypothetical protein  47.24 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2155  hypothetical protein  43.75 
 
 
133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1226  GCN5-related N-acetyltransferase  44.53 
 
 
314 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000639538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  45.74 
 
 
331 aa  107  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56750  hypothetical protein  46.88 
 
 
133 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1913  hypothetical protein  40.48 
 
 
131 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.307304  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3028  hypothetical protein  42.62 
 
 
135 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.398731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3135  hypothetical protein  46.09 
 
 
131 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1115  hypothetical protein  42.97 
 
 
137 aa  103  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2800  hypothetical protein  43.9 
 
 
132 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0767  transporter  43.31 
 
 
131 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0100171  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1603  hypothetical protein  40.77 
 
 
133 aa  100  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000462235  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0329  hypothetical protein  42.64 
 
 
132 aa  97.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  44.17 
 
 
292 aa  97.1  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1461  hypothetical protein  41.27 
 
 
132 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4867  hypothetical protein  40.65 
 
 
130 aa  91.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00684  hypothetical protein  42.06 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1423  hypothetical protein  46.49 
 
 
138 aa  87.8  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.969669  hitchhiker  0.000000364034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1874  hypothetical protein  39.06 
 
 
136 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.636885  normal  0.0948364 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6119  hypothetical protein  40.62 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1959  hypothetical protein  40.62 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1947  hypothetical protein  39.06 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1983  hypothetical protein  40.48 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5270  hypothetical protein  40.62 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2290  Protein of unknown function DUF2241  32.56 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.257133  normal  0.718354 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2975  conserved hypothetical protein-like protein  26.79 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>