33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0877 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0877  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1683  hypothetical protein  54.26 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.727373 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2664  hypothetical protein  59.06 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1749  hypothetical protein  53.44 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6513  hypothetical protein  52.38 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4484  hypothetical protein  49.61 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4935  hypothetical protein  51.94 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56750  hypothetical protein  52.71 
 
 		 133 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4678  hypothetical protein  47.69 
 
 		 135 aa  124  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2155  hypothetical protein  44.96 
 
 		 133 aa  120  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3028  hypothetical protein  44.96 
 
 		 135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3135  hypothetical protein  45.74 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1115  hypothetical protein  39.71 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1461  hypothetical protein  45.38 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0329  hypothetical protein  48.85 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1913  hypothetical protein  43.61 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.307304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0767  transporter  44.85 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0100171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  43.66 
 
 		 331 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2800  hypothetical protein  39.06 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1603  hypothetical protein  44.27 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000462235  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  48.36 
 
 		 292 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1226  GCN5-related N-acetyltransferase  41.73 
 
 		 314 aa  100  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000639538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4867  hypothetical protein  34.62 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1959  hypothetical protein  44.7 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6119  hypothetical protein  44.7 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1874  hypothetical protein  44.62 
 
 		 136 aa  87.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.636885  normal  0.0948364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1983  hypothetical protein  43.41 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00684  hypothetical protein  38.17 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1947  hypothetical protein  43.41 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1423  hypothetical protein  44.35 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.969669  hitchhiker  0.000000364034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5270  hypothetical protein  44.19 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2290  Protein of unknown function DUF2241  37.01 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.257133  normal  0.718354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0227  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.3 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>