33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1461 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1461  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  273  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0329  hypothetical protein  60.47 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1913  hypothetical protein  59.23 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.307304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0767  transporter  56.92 
 
 		 131 aa  151  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0100171  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3135  hypothetical protein  56.59 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1603  hypothetical protein  58.78 
 
 		 133 aa  148  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000462235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2800  hypothetical protein  51.13 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4678  hypothetical protein  46.15 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4484  hypothetical protein  49.62 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0877  hypothetical protein  45.38 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4935  hypothetical protein  44.62 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1115  hypothetical protein  42.31 
 
 		 137 aa  105  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  51.2 
 
 		 292 aa  105  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1683  hypothetical protein  38.64 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.727373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4867  hypothetical protein  44.27 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00684  hypothetical protein  46.56 
 
 		 132 aa  103  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3028  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2155  hypothetical protein  42.64 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56750  hypothetical protein  44.62 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6513  hypothetical protein  41.27 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1226  GCN5-related N-acetyltransferase  39.23 
 
 		 314 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000639538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  38.81 
 
 		 331 aa  90.5  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2664  hypothetical protein  41.32 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1423  hypothetical protein  42.28 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.969669  hitchhiker  0.000000364034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1874  hypothetical protein  43.59 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.636885  normal  0.0948364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1947  hypothetical protein  42.74 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1749  hypothetical protein  38.28 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1983  hypothetical protein  43.59 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1959  hypothetical protein  42.06 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6119  hypothetical protein  42.06 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5270  hypothetical protein  44.54 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2290  Protein of unknown function DUF2241  34.65 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.257133  normal  0.718354 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2975  conserved hypothetical protein-like protein  24 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>