36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4678 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4678  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  268  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1683  hypothetical protein  55.97 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.727373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2155  hypothetical protein  52.34 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4484  hypothetical protein  47.01 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4935  hypothetical protein  50.38 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3028  hypothetical protein  47.69 
 
 		 135 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398731 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0877  hypothetical protein  47.69 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0767  transporter  47.69 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0100171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1115  hypothetical protein  46.92 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1461  hypothetical protein  46.15 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56750  hypothetical protein  50.38 
 
 		 133 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2800  hypothetical protein  46.15 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1749  hypothetical protein  46.46 
 
 		 136 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6513  hypothetical protein  45.53 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0329  hypothetical protein  46.83 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3135  hypothetical protein  44.53 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2664  hypothetical protein  42.75 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1603  hypothetical protein  44.27 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000462235  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1913  hypothetical protein  40.77 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.307304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4867  hypothetical protein  41.67 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  48.36 
 
 		 292 aa  103  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1226  GCN5-related N-acetyltransferase  42.54 
 
 		 314 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000639538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  39.23 
 
 		 331 aa  90.1  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1423  hypothetical protein  44.92 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.969669  hitchhiker  0.000000364034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00684  hypothetical protein  40.91 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1874  hypothetical protein  46.88 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.636885  normal  0.0948364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1947  hypothetical protein  46.09 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1983  hypothetical protein  45.19 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1959  hypothetical protein  43.75 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6119  hypothetical protein  43.75 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5270  hypothetical protein  44.53 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2290  Protein of unknown function DUF2241  40.32 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.257133  normal  0.718354 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26520  hypothetical protein  47.17 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0892158  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1001  hypothetical protein  34.25 
 
 		 129 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0227  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.71 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0890  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.92 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0186832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>